More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2724 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  98.76 
 
 		 322 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  98.76 
 
 		 322 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  98.76 
 
 		 322 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  98.76 
 
 		 322 aa  659    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  98.76 
 
 		 322 aa  659    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  98.76 
 
 		 322 aa  661    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  100 
 
 		 322 aa  670    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  98.76 
 
 		 322 aa  659    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  99.38 
 
 		 322 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  89.44 
 
 		 323 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  89.13 
 
 		 323 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  89.13 
 
 		 323 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  89.44 
 
 		 323 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  89.44 
 
 		 323 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  85.4 
 
 		 322 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.35 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.28 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  60.3 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  56.59 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.7 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  58.91 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  58.91 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  58.91 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.71 
 
 		 380 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.4 
 
 		 376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.41 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.96 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.84 
 
 		 361 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.54 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.72 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  34.78 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.6 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.85 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.64 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.73 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  33.83 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  32.05 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.52 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.52 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.38 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  33.55 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.26 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.01 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.67 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  30.06 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.99 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.99 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  31.79 
 
 		 382 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31.79 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.79 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.79 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  32.06 
 
 		 381 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  29.68 
 
 		 362 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.09 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.06 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.06 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.33 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.81 
 
 		 383 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  32.94 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  29.14 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  29.2 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.47 
 
 		 381 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.14 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.47 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.47 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  29.2 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.47 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.4 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  31.3 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  28.09 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  28.37 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.94 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.45 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.4 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  27.49 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  30.35 
 
 		 627 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.38 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  29.14 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.49 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  28.19 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  27 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  27 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.06 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.71 
 
 		 363 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.71 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  27.9 
 
 		 597 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  32.64 
 
 		 381 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.73 
 
 		 702 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.14 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.7 
 
 		 585 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  29.32 
 
 		 670 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.08 
 
 		 625 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  27.7 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.73 
 
 		 669 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.31 
 
 		 688 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  32.32 
 
 		 662 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  33.78 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.7 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.14 
 
 		 585 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  26.47 
 
 		 350 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>