120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2680 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  847    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  100 
 
 
410 aa  847    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  74.69 
 
 
409 aa  648    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  847    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  99.02 
 
 
410 aa  835    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  847    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  99.02 
 
 
410 aa  835    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  98.78 
 
 
410 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  77.26 
 
 
410 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  77.26 
 
 
410 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  76.53 
 
 
410 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  77.26 
 
 
410 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  77.02 
 
 
410 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  98.78 
 
 
410 aa  832    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  847    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  55.88 
 
 
408 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  55.53 
 
 
416 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  51.9 
 
 
409 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  51.9 
 
 
409 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  51.79 
 
 
444 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  51.79 
 
 
444 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  51.79 
 
 
444 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  51.79 
 
 
416 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  51.41 
 
 
404 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  51.28 
 
 
423 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  51.52 
 
 
403 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  51.52 
 
 
403 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  51.27 
 
 
403 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  50.92 
 
 
403 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  51.97 
 
 
466 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  50.26 
 
 
403 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  50.13 
 
 
403 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  45.73 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  44.07 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  39.65 
 
 
388 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  43.25 
 
 
401 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  37.93 
 
 
409 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  39.44 
 
 
450 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  39.89 
 
 
402 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  41.23 
 
 
402 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  35.64 
 
 
410 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  35.57 
 
 
406 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  35.86 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  37.16 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  36.41 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  31.7 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  37.72 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  35.9 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  37.82 
 
 
415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  33.42 
 
 
396 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  32.36 
 
 
399 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  35.04 
 
 
390 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  35.47 
 
 
410 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  35.9 
 
 
407 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  33.81 
 
 
392 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  33.33 
 
 
411 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  35.41 
 
 
390 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  32.99 
 
 
397 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  35.61 
 
 
389 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  35.49 
 
 
402 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  36.05 
 
 
415 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  34.29 
 
 
401 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  34.19 
 
 
449 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  35.34 
 
 
432 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  37.39 
 
 
397 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  32.98 
 
 
388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  36.12 
 
 
437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  34.22 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  33.07 
 
 
388 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  32.55 
 
 
388 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  33.82 
 
 
419 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  33.78 
 
 
398 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  33.93 
 
 
393 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  33.8 
 
 
388 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  32.34 
 
 
402 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  31.97 
 
 
389 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  33.16 
 
 
385 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  34.66 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  33.83 
 
 
406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  31.89 
 
 
404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  33.24 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  30.38 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  31.04 
 
 
402 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  33 
 
 
402 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  33.85 
 
 
403 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  33.08 
 
 
393 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  33.5 
 
 
441 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2178  protein of unknown function DUF1006  34.33 
 
 
405 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0894298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2383  hypothetical protein  32.02 
 
 
411 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0214821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  31.83 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  32.18 
 
 
404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  32.18 
 
 
404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  32.18 
 
 
404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  34.54 
 
 
406 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  34.54 
 
 
406 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  33.79 
 
 
413 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  33.16 
 
 
362 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3809  protein of unknown function DUF1006  32.94 
 
 
428 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4005  hypothetical protein  32.98 
 
 
408 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  31.52 
 
 
387 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>