234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2371 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  99.53 
 
 
212 aa  433  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  96.7 
 
 
212 aa  417  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  96.7 
 
 
212 aa  417  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  96.7 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  89.15 
 
 
212 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  89.15 
 
 
212 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  88.68 
 
 
212 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  88.68 
 
 
212 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  88.68 
 
 
212 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  80.66 
 
 
211 aa  356  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  63.68 
 
 
210 aa  280  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  61.79 
 
 
210 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  62.74 
 
 
210 aa  274  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  58.96 
 
 
211 aa  270  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  58.96 
 
 
211 aa  270  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  58.96 
 
 
211 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  60.85 
 
 
210 aa  267  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  61.57 
 
 
223 aa  264  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  57.01 
 
 
214 aa  254  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  57.48 
 
 
213 aa  250  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  55.05 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  52.78 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  53.24 
 
 
215 aa  231  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  51.85 
 
 
215 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  51.85 
 
 
215 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  52.09 
 
 
214 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  51.87 
 
 
213 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  54.33 
 
 
215 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  52.78 
 
 
214 aa  227  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  51.85 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  50.93 
 
 
214 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  51.15 
 
 
214 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  51.15 
 
 
215 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  47.2 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  50.23 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  49.77 
 
 
214 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  49.77 
 
 
214 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  48.83 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  46.43 
 
 
224 aa  191  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  47.62 
 
 
228 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  44.64 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  43.3 
 
 
227 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  47.47 
 
 
209 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  43.83 
 
 
232 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  43.83 
 
 
232 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  46.57 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  45.63 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  45.54 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  46.04 
 
 
227 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  43.4 
 
 
202 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  45.05 
 
 
227 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  44.59 
 
 
218 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  41.23 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  40.59 
 
 
237 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  35.87 
 
 
224 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  40.28 
 
 
209 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  41.07 
 
 
217 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  35.27 
 
 
226 aa  141  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  40.84 
 
 
216 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  38.32 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  37.5 
 
 
202 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  39.89 
 
 
203 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  39.89 
 
 
201 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  38.22 
 
 
210 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  34.96 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  36.87 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  38.3 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  35.48 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  34.25 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  37.32 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  37.32 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  37.32 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  37.32 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  37.32 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  32.98 
 
 
209 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  35.64 
 
 
200 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  37.5 
 
 
239 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  38.1 
 
 
239 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  36.17 
 
 
213 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  35.26 
 
 
222 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  37.77 
 
 
194 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  37.77 
 
 
194 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  36.84 
 
 
214 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  35.02 
 
 
198 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  35.04 
 
 
241 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  34.45 
 
 
241 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  37.76 
 
 
206 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  34.4 
 
 
227 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  35.64 
 
 
213 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  35.64 
 
 
212 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  35.64 
 
 
221 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  35.64 
 
 
212 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  35.64 
 
 
212 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  35.64 
 
 
216 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  35.6 
 
 
200 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>