13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2352 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2373  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000378539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 46 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000761288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2352  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000587342  unclonable  0.0000000147196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1502  hypothetical protein  100 
 
 		 46 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0155858  hitchhiker  6.5416100000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01262  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.189979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1855  hypothetical protein  95.24 
 
 		 42 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.34103  hitchhiker  9.775509999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1838  hypothetical protein  88.1 
 
 		 42 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.12449e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1901  hypothetical protein  88.1 
 
 		 42 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.27377e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1843  hypothetical protein  88.1 
 
 		 42 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1435  hypothetical protein  88.1 
 
 		 42 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00115021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1616  hypothetical protein  88.1 
 
 		 42 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  hitchhiker  5.03185e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2194  hypothetical protein  76.19 
 
 		 42 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.495564  hitchhiker  0.0000297586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>