19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2318 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2318  peripheral inner membrane phage-shock protein  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00493447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01295  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1949  peripheral inner membrane phage-shock protein  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1815  peripheral inner membrane phage-shock protein  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.303275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01284  peripheral inner membrane phage-shock protein  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1517  peripheral inner membrane phage-shock protein  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1422  peripheral inner membrane phage-shock protein  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2339  phage shock protein PspD  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00209124  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1543  peripheral inner membrane phage-shock protein  98.63 
 
 		 73 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1873  peripheral inner membrane phage-shock protein  87.5 
 
 		 72 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1812  peripheral inner membrane phage-shock protein  86.11 
 
 		 72 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.195745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1645  peripheral inner membrane phage-shock protein  86.11 
 
 		 72 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1463  peripheral inner membrane phage-shock protein  86.11 
 
 		 72 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1811  peripheral inner membrane phage-shock protein  84.72 
 
 		 72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2166  peripheral inner membrane phage-shock protein  70.42 
 
 		 73 aa  110  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2621  peripheral inner membrane phage-shock protein  45.1 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.335736  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1897  peripheral inner membrane phage-shock protein  43.4 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.660254  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1789  peripheral inner membrane phage-shock protein  43.4 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2534  peripheral inner membrane phage-shock protein  46.81 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>