More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2209 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  99.55 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  99.55 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  99.1 
 
 		 221 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  99.1 
 
 		 221 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  99.1 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  98.64 
 
 		 221 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  94.12 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  58.45 
 
 		 221 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  58.45 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  58.45 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  58.45 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  58.45 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 222 aa  191  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  47.66 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1721  transcriptional regulator, GntR family protein  100 
 
 		 97 aa  177  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 248 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  33.66 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 266 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  33.68 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 244 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  92  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  32.64 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 280 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  31.74 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  26.96 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  30.49 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  29.9 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>