223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2146 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  99.37 
 
 
317 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  100 
 
 
317 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  99.37 
 
 
317 aa  634    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
317 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  100 
 
 
317 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  99.37 
 
 
317 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  77.64 
 
 
319 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  77.64 
 
 
319 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  77.64 
 
 
319 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  77.64 
 
 
319 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  77.64 
 
 
319 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  68.32 
 
 
331 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  68.32 
 
 
306 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  55.05 
 
 
319 aa  355  5e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  38.49 
 
 
316 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  38.49 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  38.49 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  38.82 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  38.49 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  38.49 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  38.16 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  38.16 
 
 
313 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  38.16 
 
 
362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
310 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  31.61 
 
 
323 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  32.58 
 
 
320 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  32.9 
 
 
321 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  31.96 
 
 
319 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  32.15 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  28.26 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  32.04 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  30.55 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  29.85 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  28.06 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  26.71 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  30.84 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
317 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
317 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  29.93 
 
 
333 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
333 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  28.06 
 
 
338 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  30.7 
 
 
317 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
310 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  27.94 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  31.35 
 
 
700 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  26.18 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  31.48 
 
 
694 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  29.04 
 
 
334 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  31.91 
 
 
694 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  29.34 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  30.35 
 
 
318 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  29.34 
 
 
315 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  29.34 
 
 
315 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
318 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  30.35 
 
 
318 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
335 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
310 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  29.03 
 
 
315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  30.57 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  25.24 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  28.94 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  29.15 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  29.15 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  29.15 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  29.15 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  29.15 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
339 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 
325 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 
325 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  25.72 
 
 
310 aa  113  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
315 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  27.76 
 
 
314 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
314 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  27.76 
 
 
314 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  30.36 
 
 
695 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  30.16 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  27.83 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>