119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1981 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  98.73 
 
 
125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 
79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  82.28 
 
 
81 aa  141  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  73.42 
 
 
121 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  73.42 
 
 
121 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  67.09 
 
 
79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  63.29 
 
 
79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  64.56 
 
 
79 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  47.87 
 
 
103 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  67.27 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  60.29 
 
 
104 aa  87.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  60.66 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  51.9 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  53.42 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  53.42 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  53.33 
 
 
102 aa  84.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  64.52 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  54.79 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  54.79 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  52.05 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  49.33 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  53.42 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  53.42 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  50.68 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  76 
 
 
50 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  76 
 
 
50 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  76 
 
 
50 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  76 
 
 
50 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  76 
 
 
50 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  54.24 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  51.61 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  61.22 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  62.75 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  43.04 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  37.33 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  52.83 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  46.67 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  45 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  45.83 
 
 
60 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  44.9 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  46.94 
 
 
72 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  44.9 
 
 
71 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  42.86 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  44.9 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2562  hypothetical protein  65.79 
 
 
38 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  46.94 
 
 
64 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  41.18 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  40.68 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  43.14 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42 
 
 
250 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  46.67 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 
88 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  34.38 
 
 
64 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  46.67 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  36.51 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  50 
 
 
285 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  44.9 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  48.84 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  48.84 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  42 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  42.22 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  45.83 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38.98 
 
 
267 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  43.75 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  41.3 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  42.22 
 
 
57 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  46.51 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  38.81 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  38.89 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  48.78 
 
 
52 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  39.13 
 
 
88 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  38.1 
 
 
65 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  38 
 
 
248 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  42.22 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  37.78 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  42.86 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  32.86 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  37.1 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  37.78 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  32.81 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  32.39 
 
 
72 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  35.82 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  35.82 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  40.48 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  37.7 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  39.53 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  35.82 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>