More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1783 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  99.23 
 
 
392 aa  790  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1338  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  98.72 
 
 
392 aa  786  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2124  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  98.47 
 
 
392 aa  785  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01808  hypothetical protein  99.23 
 
 
392 aa  790  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2042  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  88.52 
 
 
392 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.489284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  88.01 
 
 
392 aa  707  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.310007  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2037  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  88.01 
 
 
392 aa  707  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1241  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  88.01 
 
 
392 aa  707  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  88.27 
 
 
392 aa  709  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.13864e-07 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  100 
 
 
392 aa  796  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  98.98 
 
 
392 aa  787  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1792  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  98.72 
 
 
392 aa  787  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00174349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2351  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  77.81 
 
 
393 aa  640  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2418  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  82.65 
 
 
392 aa  671  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1941  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  99.74 
 
 
392 aa  794  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2079  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  99.23 
 
 
392 aa  788  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1634  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  78.06 
 
 
393 aa  641  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2447  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  78.06 
 
 
393 aa  641  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2242  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  76.41 
 
 
393 aa  624  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1834  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  78.32 
 
 
392 aa  612  1e-174  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2805  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  78.06 
 
 
392 aa  612  1e-174  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  78.34 
 
 
392 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2118  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  77.55 
 
 
392 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0850  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  70.41 
 
 
393 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02115  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  68.89 
 
 
391 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  70.57 
 
 
391 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.61 
 
 
391 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.61 
 
 
391 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.862074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0973  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  68.12 
 
 
391 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000246757  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.61 
 
 
391 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  68.72 
 
 
392 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1686  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.18 
 
 
391 aa  541  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1092  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.61 
 
 
391 aa  540  1e-152  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0871  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.55 
 
 
391 aa  538  1e-152  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000494924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  68.62 
 
 
393 aa  539  1e-152  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.61 
 
 
391 aa  540  1e-152  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3613  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.15 
 
 
378 aa  538  1e-152  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1001  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  68.12 
 
 
391 aa  538  1e-152  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3070  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.15 
 
 
396 aa  534  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.636645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  68.37 
 
 
393 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1059  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.35 
 
 
391 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  68.37 
 
 
393 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3300  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.35 
 
 
391 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.82 
 
 
393 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4162  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  68.37 
 
 
393 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1277  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.82 
 
 
393 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05935  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.86 
 
 
393 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.84 
 
 
393 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2767  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.01 
 
 
393 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.6 
 
 
393 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.17999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.01 
 
 
396 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1367  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.6 
 
 
393 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.19 
 
 
393 aa  522  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000381873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.04 
 
 
400 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00049074  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0549  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.54 
 
 
393 aa  518  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.56 
 
 
393 aa  516  1e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630931  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.32 
 
 
400 aa  504  1e-142  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  67.64 
 
 
395 aa  504  1e-142  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.881865  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1966  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.71 
 
 
393 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2756  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.07 
 
 
393 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.966815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.8 
 
 
393 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  66.84 
 
 
403 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0302  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.15 
 
 
392 aa  471  1e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.51651e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3193  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.41 
 
 
392 aa  468  1e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.78447e-11  hitchhiker  1.55264e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0160  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.44 
 
 
392 aa  467  1e-130  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
393 aa  465  1e-130  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.13017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.78 
 
 
399 aa  466  1e-130  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229559  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.93 
 
 
392 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2009  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.44 
 
 
400 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1390  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.31 
 
 
394 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1245  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.18 
 
 
404 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.816462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.37 
 
 
404 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2358  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.83 
 
 
404 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739555  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3144  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65 
 
 
408 aa  455  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.520225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5661  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.78 
 
 
404 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541626  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0081  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.36 
 
 
415 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.338109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.68 
 
 
404 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2342  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.3 
 
 
404 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0158257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.57 
 
 
404 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.57 
 
 
404 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.3 
 
 
404 aa  453  1e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0979  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.52 
 
 
476 aa  451  1e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.78 
 
 
404 aa  452  1e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2238  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  64.3 
 
 
404 aa  453  1e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335743  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0832  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.52 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.52 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1196  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.52 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1349  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.52 
 
 
464 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1922  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.52 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.244182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0318  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.52 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0201005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3291  Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  63.47 
 
 
399 aa  446  1e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2474  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.62 
 
 
401 aa  445  1e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530276  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0775  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.43 
 
 
398 aa  441  1e-122  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.486774  normal  0.246438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.7 
 
 
400 aa  440  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220765 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.56 
 
 
388 aa  438  1e-122  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0434  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.28 
 
 
394 aa  441  1e-122  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298565  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.78 
 
 
388 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.19 
 
 
413 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4943  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.15 
 
 
400 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0527  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.5 
 
 
590 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>