178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1731 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  100 
 
 
165 aa  343  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  100 
 
 
165 aa  343  8e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  100 
 
 
165 aa  343  8e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.46321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  100 
 
 
165 aa  343  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  343  8e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  100 
 
 
165 aa  343  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.4289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  100 
 
 
165 aa  343  8e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90475e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  99.39 
 
 
165 aa  341  3e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  1.16181e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  99.39 
 
 
165 aa  340  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  92.73 
 
 
165 aa  323  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  4.82664e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  92.73 
 
 
165 aa  323  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  92.73 
 
 
165 aa  323  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  92.12 
 
 
165 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  92.12 
 
 
165 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  4.65713e-11 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  87.88 
 
 
165 aa  310  5e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  66.26 
 
 
172 aa  238  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  64.24 
 
 
169 aa  233  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  64.24 
 
 
169 aa  233  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  64.24 
 
 
169 aa  233  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  64.6 
 
 
175 aa  229  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  65.64 
 
 
169 aa  228  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  65.03 
 
 
168 aa  226  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  62.42 
 
 
178 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  62.42 
 
 
178 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  62.42 
 
 
178 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  62.42 
 
 
178 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  65.22 
 
 
168 aa  224  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  64.42 
 
 
166 aa  224  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  62.42 
 
 
178 aa  224  5e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  62.42 
 
 
178 aa  224  5e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  62.42 
 
 
178 aa  224  5e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  61.82 
 
 
178 aa  224  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  63.41 
 
 
175 aa  223  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  61.21 
 
 
178 aa  221  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  61.49 
 
 
175 aa  220  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  60.87 
 
 
175 aa  219  1e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  60.87 
 
 
175 aa  219  1e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  62.73 
 
 
181 aa  218  2e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  61.49 
 
 
175 aa  219  2e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  59.76 
 
 
174 aa  216  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  61.49 
 
 
175 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  59.01 
 
 
175 aa  214  6e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  55.9 
 
 
161 aa  196  1e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  52.8 
 
 
175 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  55.28 
 
 
165 aa  183  1e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  50.31 
 
 
162 aa  174  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  47.2 
 
 
164 aa  167  6e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  47.2 
 
 
167 aa  162  1e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  47.2 
 
 
167 aa  162  1e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  47.2 
 
 
167 aa  162  2e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  45.96 
 
 
166 aa  154  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  45.28 
 
 
169 aa  135  3e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  41.51 
 
 
171 aa  134  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  40.25 
 
 
170 aa  132  2e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  39.13 
 
 
172 aa  130  7e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  40.62 
 
 
176 aa  129  2e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  37.89 
 
 
176 aa  128  4e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  40.62 
 
 
173 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  40 
 
 
176 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.24545e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  39.38 
 
 
172 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48628e-10 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  38.36 
 
 
163 aa  123  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  38.99 
 
 
172 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  38.79 
 
 
171 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  37.58 
 
 
165 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  38.99 
 
 
161 aa  120  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  38.12 
 
 
172 aa  119  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  37.58 
 
 
165 aa  117  5e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  35.62 
 
 
171 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  35.22 
 
 
168 aa  117  8e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.92038e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  38.36 
 
 
173 aa  116  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.65061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  36.02 
 
 
163 aa  116  1e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.82999e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  35.85 
 
 
173 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.53889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  35.62 
 
 
170 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.20561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  38.06 
 
 
175 aa  115  4e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  38.51 
 
 
172 aa  114  7e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  39.62 
 
 
171 aa  113  1e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.23127e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  33.96 
 
 
171 aa  112  2e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  34.38 
 
 
170 aa  111  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.19081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  38.36 
 
 
177 aa  110  7e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  40 
 
 
171 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  35.62 
 
 
171 aa  110  1e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2478  Ferritin, Dps family protein  39.19 
 
 
167 aa  109  1e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  36.25 
 
 
166 aa  109  2e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2087  ferritin  36.08 
 
 
167 aa  109  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  1.11802e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2147  ferritin  36.08 
 
 
167 aa  109  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.77391e-21 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1189  ferritin, Dps family protein  36.08 
 
 
167 aa  109  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1313  ferritin  36.08 
 
 
167 aa  109  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79199e-14 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2093  ferritin, Dps family protein  36.08 
 
 
167 aa  109  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  hitchhiker  3.99578e-21 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 
162 aa  109  2e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  37.11 
 
 
164 aa  109  2e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  35.8 
 
 
174 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.15587e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  34.38 
 
 
168 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  3.23257e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  33.96 
 
 
174 aa  108  4e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.56866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  33.96 
 
 
164 aa  107  8e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  39.35 
 
 
164 aa  106  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  4.4787e-12 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  34.64 
 
 
167 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  35 
 
 
166 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  38.75 
 
 
169 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  35 
 
 
166 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
175 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>