More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1719 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  100 
 
 
285 aa  575  1e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  99.65 
 
 
285 aa  572  1e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  100 
 
 
266 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  99.62 
 
 
266 aa  534  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  99.25 
 
 
266 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  99.25 
 
 
266 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  99.25 
 
 
266 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  92.11 
 
 
266 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  92.86 
 
 
266 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  92.86 
 
 
266 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.88454e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  92.86 
 
 
266 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.83389e-11 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  92.11 
 
 
266 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  91.35 
 
 
266 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  80.69 
 
 
265 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  74.06 
 
 
266 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  74.06 
 
 
266 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  74.06 
 
 
266 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  63.91 
 
 
265 aa  356  3e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  65.04 
 
 
265 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  64.31 
 
 
268 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  61.28 
 
 
264 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  63.06 
 
 
266 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  65.02 
 
 
264 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  65.43 
 
 
264 aa  320  1e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  65.43 
 
 
264 aa  320  1e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  57.94 
 
 
265 aa  268  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.86 
 
 
264 aa  214  2e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  45.9 
 
 
266 aa  212  5e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  1.79971e-09 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  46.41 
 
 
266 aa  212  5e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  42.53 
 
 
264 aa  212  6e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  45.9 
 
 
266 aa  212  6e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  46.41 
 
 
266 aa  212  6e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  46.41 
 
 
266 aa  212  6e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  45.9 
 
 
266 aa  212  6e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.9 
 
 
266 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.53 
 
 
264 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 
264 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  44.79 
 
 
266 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  45.06 
 
 
264 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  45.06 
 
 
264 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  45.06 
 
 
264 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  45.06 
 
 
264 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  44.27 
 
 
264 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.66 
 
 
264 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 
270 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
284 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
264 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
264 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
264 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
264 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
264 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
264 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.91 
 
 
267 aa  199  4e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.85 
 
 
266 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 
270 aa  197  2e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 
266 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  43.36 
 
 
253 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  39.48 
 
 
277 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.15158e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  41.53 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.24 
 
 
266 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  41.28 
 
 
320 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  41.28 
 
 
266 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  41.28 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  36.05 
 
 
264 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  41.11 
 
 
256 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  40.71 
 
 
290 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  41.11 
 
 
256 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 
266 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
265 aa  184  2e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 
264 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.28 
 
 
264 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  41.28 
 
 
313 aa  181  8e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0777  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  41.28 
 
 
313 aa  181  8e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2611  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  41.28 
 
 
313 aa  181  8e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  42.74 
 
 
257 aa  179  3e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 
257 aa  179  6e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 
265 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  39.06 
 
 
265 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.06 
 
 
265 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.06 
 
 
265 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  39.06 
 
 
265 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.06 
 
 
265 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.06 
 
 
265 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.67 
 
 
265 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.67 
 
 
265 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.67 
 
 
265 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 
252 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.38 
 
 
260 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.7 
 
 
257 aa  174  1e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.7 
 
 
257 aa  174  1e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  40.09 
 
 
502 aa  174  2e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  40.09 
 
 
502 aa  174  2e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  41.28 
 
 
273 aa  174  2e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  38.93 
 
 
260 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  41.28 
 
 
260 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  41.03 
 
 
257 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  40.25 
 
 
260 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  40.25 
 
 
260 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  40.25 
 
 
260 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 
250 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>