47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1409 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1417  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  100 
 
 		 419 aa  848    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02127  hypothetical protein  98.57 
 
 		 419 aa  837    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3379  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  98.09 
 
 		 419 aa  834    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2629  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  81.38 
 
 		 419 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.469709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2421  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  81.15 
 
 		 419 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  81.38 
 
 		 419 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2525  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  81.15 
 
 		 419 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  81.15 
 
 		 419 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2624  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  98.57 
 
 		 419 aa  837    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2394  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  98.57 
 
 		 419 aa  836    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1409  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 419 aa  848    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2540  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  99.05 
 
 		 419 aa  842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2383  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  98.57 
 
 		 419 aa  837    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02168  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  98.57 
 
 		 419 aa  837    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2806  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  66.83 
 
 		 419 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.639346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  52.28 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3956  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4147  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  48.67 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0566  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.76 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0228  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.76 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3990  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.76 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.523748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  46.3 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0249  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  45.78 
 
 		 418 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.084897  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  40.28 
 
 		 432 aa  315  9e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.171516  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0396  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.07 
 
 		 452 aa  302  9e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0687  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.77 
 
 		 436 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1020  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  35.75 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.33 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2101  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.11 
 
 		 424 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2517  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.48 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3498  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.33 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0070  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.86 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1437  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.14 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1229  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.23 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1520  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.23 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0570391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4112  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.62 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.889687  normal  0.0200545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2843  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.17 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580036  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1124  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25.05 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3389  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.6 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  28.21 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  28.23 
 
 		 449 aa  99.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3300  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.49 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1318  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.65 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2531  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.77 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1337  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.89 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.766172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1420  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.67 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.57 
 
 		 307 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>