More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1375 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 509 aa  1014    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 		 509 aa  1014    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  72.83 
 
 		 509 aa  723    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  73.57 
 
 		 510 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  96.66 
 
 		 509 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  83.73 
 
 		 511 aa  843    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  70.33 
 
 		 514 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  72.78 
 
 		 510 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  72.39 
 
 		 510 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  96.86 
 
 		 509 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  85.58 
 
 		 510 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1014    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  85.6 
 
 		 511 aa  862    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  73.37 
 
 		 510 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  73.57 
 
 		 510 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  85.38 
 
 		 510 aa  866    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 		 510 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  94.11 
 
 		 509 aa  923    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  72.73 
 
 		 509 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  99.8 
 
 		 509 aa  1012    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 509 aa  1014    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  73.96 
 
 		 510 aa  675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  87.3 
 
 		 509 aa  884    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 509 aa  1014    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  96.86 
 
 		 509 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  96.86 
 
 		 509 aa  969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  85.38 
 
 		 510 aa  866    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  84.42 
 
 		 532 aa  844    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 509 aa  1014    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  65.47 
 
 		 513 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  68.24 
 
 		 507 aa  690    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  86.19 
 
 		 511 aa  871    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  97.05 
 
 		 509 aa  972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  72.53 
 
 		 509 aa  712    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 509 aa  1014    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  72.83 
 
 		 509 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 509 aa  1014    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  61.3 
 
 		 541 aa  620  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  60.92 
 
 		 541 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  57.07 
 
 		 577 aa  592  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.37 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.23 
 
 		 493 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  53.6 
 
 		 489 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.82 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.69 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.05 
 
 		 537 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.8 
 
 		 493 aa  392  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.64 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  41.91 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.49 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.33 
 
 		 496 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.45 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.72 
 
 		 497 aa  343  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.05 
 
 		 481 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  39.22 
 
 		 501 aa  339  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.96 
 
 		 535 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.09 
 
 		 542 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.38 
 
 		 480 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.09 
 
 		 542 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.09 
 
 		 542 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.35 
 
 		 519 aa  334  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.81 
 
 		 481 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1700  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.7 
 
 		 486 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0282324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  40.29 
 
 		 502 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.16 
 
 		 535 aa  333  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.83 
 
 		 534 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 		 502 aa  333  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  36.95 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  39.79 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.28 
 
 		 495 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1747  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.3 
 
 		 486 aa  329  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.66 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  39.53 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.45 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.45 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.45 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  39.56 
 
 		 505 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  38.46 
 
 		 494 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.46 
 
 		 494 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.28 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  39.08 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  39.48 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  39.45 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  39.45 
 
 		 496 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.59 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.09 
 
 		 504 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.63 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.38 
 
 		 494 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1039  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39 
 
 		 488 aa  322  8e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.25 
 
 		 506 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  35.9 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  39.16 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>