More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1363 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02214  DNA-binding transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes  100 
 
 		 312 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1367  transcriptional regulator, LysR family  99.36 
 
 		 312 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.189941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2665  transcriptional regulator LrhA  99.68 
 
 		 312 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0194806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1363  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3428  transcriptional regulator LrhA  99.36 
 
 		 312 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2444  transcriptional regulator LrhA  100 
 
 		 312 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2582  transcriptional regulator LrhA  99.68 
 
 		 312 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.210285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2438  transcriptional regulator LrhA  100 
 
 		 312 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.340717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02174  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2676  HTH-type transcriptional regulator PecT  86.54 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.784227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2514  HTH-type transcriptional regulator PecT  86.54 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00051335  normal  0.704874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2469  HTH-type transcriptional regulator PecT  86.54 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000182505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2558  HTH-type transcriptional regulator PecT  86.54 
 
 		 312 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000175067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2569  HTH-type transcriptional regulator PecT  86.22 
 
 		 312 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00146874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  83.97 
 
 		 312 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 311 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  67.1 
 
 		 309 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  67.1 
 
 		 309 aa  428  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  70.28 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  67.42 
 
 		 310 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  66.67 
 
 		 316 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  68.18 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1491  transcriptional regulator, LysR family  66.67 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  48.38 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 317 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2043  LysR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0201239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3972  transcriptional regulator, LysR family  44.96 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  42.03 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  42.03 
 
 		 289 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4138  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0274  LysR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 286 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4190  LysR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 282 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3930  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.983373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.07 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 284 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2857  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  34.44 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.93 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  34.57 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2994  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3585  transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0651173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  36.53 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 299 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0607  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2942  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2512  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3885  transcriptional regulator, LysR family  34.53 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6301  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4630  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  35.04 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  35.04 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  32.1 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  31.7 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0160  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>