More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1209 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  100 
 
 
659 aa  1369    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  54.57 
 
 
639 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  66.81 
 
 
472 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  66.81 
 
 
472 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  54.57 
 
 
639 aa  732    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  100 
 
 
659 aa  1369    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  84.51 
 
 
653 aa  1162    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  54.57 
 
 
639 aa  730    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  54.57 
 
 
639 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.53 
 
 
652 aa  765    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  65.51 
 
 
472 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  100 
 
 
659 aa  1369    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  85.12 
 
 
653 aa  1169    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  65.29 
 
 
472 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  100 
 
 
659 aa  1369    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  66.59 
 
 
472 aa  654    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  99.39 
 
 
659 aa  1361    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  84.97 
 
 
653 aa  1167    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  66.81 
 
 
472 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  65.08 
 
 
472 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.43 
 
 
674 aa  840    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  66.59 
 
 
472 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  100 
 
 
659 aa  1369    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  61.43 
 
 
674 aa  840    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  76.78 
 
 
658 aa  1077    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  66.59 
 
 
472 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  54.42 
 
 
644 aa  728    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  66.38 
 
 
472 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  54.57 
 
 
639 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  65.29 
 
 
472 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  67.9 
 
 
472 aa  661    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.52 
 
 
667 aa  803    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  66.38 
 
 
472 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  99.54 
 
 
659 aa  1362    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  54.27 
 
 
641 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  66.16 
 
 
472 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  66.81 
 
 
472 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  66.38 
 
 
472 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  65.29 
 
 
472 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  66.81 
 
 
472 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.61 
 
 
671 aa  811    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  85.12 
 
 
653 aa  1170    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  65.08 
 
 
472 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.57 
 
 
671 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  84.66 
 
 
653 aa  1167    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  65.51 
 
 
472 aa  648    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  67.03 
 
 
472 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  99.7 
 
 
659 aa  1367    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  66.81 
 
 
472 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  66.81 
 
 
472 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.72 
 
 
671 aa  794    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004469  glutamate synthase [NADPH] small chain  65.29 
 
 
470 aa  628  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1955  glutamate synthase subunit beta  65.51 
 
 
471 aa  621  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00925  glutamate synthase subunit beta  63.99 
 
 
470 aa  616  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  60.39 
 
 
483 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  62.34 
 
 
472 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  62.12 
 
 
472 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  62.55 
 
 
472 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  58.56 
 
 
471 aa  598  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  61.47 
 
 
472 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  61.69 
 
 
472 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  61.47 
 
 
472 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  61.47 
 
 
472 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  61.47 
 
 
472 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  61.26 
 
 
477 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  60.69 
 
 
473 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  60.82 
 
 
477 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  59.22 
 
 
471 aa  595  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  60.22 
 
 
468 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  59.78 
 
 
468 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  59.78 
 
 
468 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  60.92 
 
 
469 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  59.78 
 
 
468 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  59.91 
 
 
468 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
468 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  59.78 
 
 
468 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  60.83 
 
 
469 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  60.43 
 
 
472 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
468 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  61.17 
 
 
467 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  59.57 
 
 
468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  61.66 
 
 
472 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  57.17 
 
 
475 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  60.09 
 
 
485 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  58.35 
 
 
468 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  58.23 
 
 
472 aa  568  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  59.35 
 
 
469 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  58.48 
 
 
468 aa  568  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  58.35 
 
 
472 aa  561  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  57.58 
 
 
469 aa  558  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  58.44 
 
 
473 aa  558  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  56.75 
 
 
469 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  57.05 
 
 
473 aa  552  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  56.4 
 
 
465 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  56.4 
 
 
465 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  56.06 
 
 
470 aa  547  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 
481 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  56.4 
 
 
473 aa  545  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  58.47 
 
 
469 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>