104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1052 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  99.87 
 
 		 1526 aa  3039    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1526 aa  3045    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  94.3 
 
 		 1565 aa  2746    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  97.05 
 
 		 1571 aa  2848    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  41.78 
 
 		 836 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.78 
 
 		 836 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  41.78 
 
 		 863 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  41.78 
 
 		 836 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  41.78 
 
 		 863 aa  626  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  42.16 
 
 		 863 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  96.61 
 
 		 236 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  53.6 
 
 		 429 aa  475  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  33.77 
 
 		 769 aa  243  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  32.14 
 
 		 732 aa  238  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  32.75 
 
 		 731 aa  238  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  33.71 
 
 		 709 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  31.84 
 
 		 773 aa  233  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  28.23 
 
 		 1441 aa  230  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  27.91 
 
 		 1541 aa  223  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  31.63 
 
 		 1008 aa  223  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  31.51 
 
 		 729 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  30.96 
 
 		 730 aa  223  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  32.77 
 
 		 638 aa  221  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  32.77 
 
 		 638 aa  221  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  32.56 
 
 		 638 aa  219  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  95.37 
 
 		 108 aa  218  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  32.01 
 
 		 759 aa  216  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  94.74 
 
 		 136 aa  215  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  94.44 
 
 		 108 aa  214  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  32.01 
 
 		 759 aa  214  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  31.4 
 
 		 733 aa  214  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  31.83 
 
 		 759 aa  211  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  31.22 
 
 		 747 aa  199  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  27.68 
 
 		 1117 aa  197  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  28.64 
 
 		 562 aa  190  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  27.4 
 
 		 800 aa  180  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  29.01 
 
 		 815 aa  158  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  34.69 
 
 		 948 aa  147  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  34.93 
 
 		 948 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  35.48 
 
 		 583 aa  139  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  34.69 
 
 		 948 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.84 
 
 		 1039 aa  136  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  34.87 
 
 		 949 aa  136  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01148  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  136  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.231444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1273  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  136  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01158  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  136  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  29.28 
 
 		 418 aa  109  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000418237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000029957  normal  0.0111859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  106  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000220122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  106  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000261063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  28.54 
 
 		 418 aa  104  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  28.54 
 
 		 418 aa  104  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  24.73 
 
 		 765 aa  85.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01157  hypothetical protein  92.31 
 
 		 73 aa  81.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  23.94 
 
 		 470 aa  76.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 714 aa  75.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  23.81 
 
 		 680 aa  75.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  25.16 
 
 		 681 aa  75.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  25.08 
 
 		 1003 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.62 
 
 		 1099 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  25.16 
 
 		 868 aa  74.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  26.09 
 
 		 1093 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 1093 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  24.43 
 
 		 1000 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  24.43 
 
 		 465 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  24.43 
 
 		 922 aa  69.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 		 968 aa  68.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  24.43 
 
 		 968 aa  68.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  24.43 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  24.52 
 
 		 1594 aa  67.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  24.55 
 
 		 2906 aa  66.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  23.46 
 
 		 2578 aa  66.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  24.55 
 
 		 1861 aa  65.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  24.42 
 
 		 1579 aa  60.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  23.85 
 
 		 1806 aa  60.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  24.13 
 
 		 1327 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  25.35 
 
 		 950 aa  57.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1369 aa  57.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  36.78 
 
 		 268 aa  56.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.25 
 
 		 1108 aa  55.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  24.21 
 
 		 1113 aa  53.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  34.88 
 
 		 480 aa  53.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1287  pertactin  27.65 
 
 		 454 aa  52.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  30.08 
 
 		 489 aa  52  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1165 aa  50.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1012 aa  50.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.55 
 
 		 868 aa  50.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1165 aa  50.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  41.3 
 
 		 489 aa  50.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  24.01 
 
 		 466 aa  50.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  44.44 
 
 		 484 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  23.43 
 
 		 997 aa  48.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  34.38 
 
 		 1593 aa  48.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  22.84 
 
 		 2926 aa  48.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  23.43 
 
 		 1004 aa  48.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  34.43 
 
 		 407 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.9 
 
 		 1067 aa  47.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>