More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1026 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  87.56 
 
 
394 aa  647  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  100 
 
 
394 aa  773  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  100 
 
 
394 aa  773  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  92.64 
 
 
394 aa  647  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  99.24 
 
 
394 aa  767  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
394 aa  771  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  92.39 
 
 
394 aa  645  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  99.49 
 
 
394 aa  769  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  92.89 
 
 
394 aa  651  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  92.13 
 
 
394 aa  641  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  92.64 
 
 
394 aa  647  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  100 
 
 
394 aa  773  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  99.08 
 
 
329 aa  574  1e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  74.94 
 
 
399 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  74.68 
 
 
399 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  74.94 
 
 
399 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  73.9 
 
 
406 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  71.39 
 
 
406 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  75.78 
 
 
399 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  70.83 
 
 
399 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  69.64 
 
 
399 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  58.42 
 
 
413 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  60.11 
 
 
395 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  49.6 
 
 
411 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  59.54 
 
 
397 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  59.33 
 
 
395 aa  328  1e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  46.68 
 
 
426 aa  318  8e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  60.99 
 
 
395 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  40.85 
 
 
394 aa  304  2e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  43.38 
 
 
399 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  42.86 
 
 
399 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  42.6 
 
 
399 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  43.28 
 
 
385 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.38 
 
 
399 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  45.76 
 
 
402 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  49.47 
 
 
416 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  47.27 
 
 
421 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  42.41 
 
 
401 aa  284  2e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 
423 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  43.85 
 
 
410 aa  273  5e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.89449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  42.71 
 
 
401 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  41.15 
 
 
401 aa  265  9e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  41.45 
 
 
401 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  41.21 
 
 
383 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 
404 aa  262  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.73 
 
 
393 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
402 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  46.21 
 
 
408 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  42.56 
 
 
399 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  40.56 
 
 
398 aa  254  2e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  42.82 
 
 
399 aa  253  4e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.82 
 
 
399 aa  253  4e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.82 
 
 
399 aa  253  4e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.82 
 
 
399 aa  253  4e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
399 aa  253  4e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  42.82 
 
 
399 aa  253  4e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  42.82 
 
 
399 aa  253  4e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.82 
 
 
405 aa  253  5e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  42.33 
 
 
404 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  43.59 
 
 
416 aa  252  9e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  41.78 
 
 
405 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  42.61 
 
 
400 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  42.9 
 
 
419 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  40.1 
 
 
409 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  43.65 
 
 
414 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.5466e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  40.91 
 
 
411 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 
403 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
410 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
422 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  41.71 
 
 
399 aa  245  1e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.85 
 
 
405 aa  244  2e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.85 
 
 
405 aa  244  2e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.85 
 
 
405 aa  243  4e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.06 
 
 
403 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  41.19 
 
 
403 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 
405 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  43.13 
 
 
415 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  38.92 
 
 
411 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  38.92 
 
 
411 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 
391 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 
387 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 
428 aa  239  7e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  38.76 
 
 
411 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 
413 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  38.2 
 
 
389 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  38.2 
 
 
389 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  42.78 
 
 
399 aa  235  1e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 
397 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  42.09 
 
 
407 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  42.41 
 
 
389 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  40.91 
 
 
411 aa  232  8e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  38.56 
 
 
405 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  38.56 
 
 
405 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  41.19 
 
 
398 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  41.71 
 
 
399 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
389 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  41.44 
 
 
399 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  41.44 
 
 
399 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  39.9 
 
 
398 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>