21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1010 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0987  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC subunit  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.222931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02517  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.567624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3175  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC component  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.512877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2825  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC component  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248277  hitchhiker  0.0000269203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1010  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC subunit  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2986  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC component  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2838  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC component  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02552  glucitol/sorbitol-specific enzyme IIC component of PTS  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.394673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3034  glucitol/sorbitol permease iic component  97.33 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  hitchhiker  0.00620119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2983  glucitol/sorbitol permease iic component  97.33 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2952  glucitol/sorbitol permease iic component  97.33 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3018  glucitol/sorbitol permease iic component  96.79 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.701742  hitchhiker  0.00000153784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3141  PTS system glucitol/sorbitol transporter subunit IIC  96.79 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3569  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC subunit  90.11 
 
 		 182 aa  340  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0679  PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIC2 component  83.61 
 
 		 184 aa  324  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000012263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1065  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC subunit  64.09 
 
 		 181 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.322017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3776  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC subunit  46.2 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000011325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2225  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIC subunit  45.56 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4109  PTS system protein II sorbitol-specific factor  42.44 
 
 		 261 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3333  PTS system protein II sorbitol-specific factor  38.51 
 
 		 178 aa  140  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2924  glucitol/sorbitol permease iic component  40.26 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.814818  hitchhiker  0.000421364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>