More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0974 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  85.78 
 
 
212 aa  363  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  85.78 
 
 
212 aa  363  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  85.78 
 
 
212 aa  363  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  85.78 
 
 
212 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  85.31 
 
 
212 aa  361  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  73.89 
 
 
218 aa  325  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  73.89 
 
 
218 aa  325  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  74.76 
 
 
210 aa  323  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  60.49 
 
 
215 aa  266  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  60.49 
 
 
210 aa  265  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  59.31 
 
 
210 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  58.5 
 
 
210 aa  250  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  54.68 
 
 
243 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  54.68 
 
 
231 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  50 
 
 
212 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  50.47 
 
 
226 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  50.75 
 
 
222 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  49.26 
 
 
224 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  49.51 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  49.26 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  48.29 
 
 
225 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  49.21 
 
 
217 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  49.02 
 
 
220 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  48.77 
 
 
221 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  48.78 
 
 
210 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  49.02 
 
 
214 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  48.78 
 
 
224 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  48.29 
 
 
211 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  48.28 
 
 
218 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  47.78 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  47.83 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  47.29 
 
 
220 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  48.29 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  45.71 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  46.31 
 
 
226 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  46.24 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  44.5 
 
 
218 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  43.63 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  45.03 
 
 
220 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  45.27 
 
 
208 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  44.62 
 
 
212 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  44.09 
 
 
212 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  47.06 
 
 
209 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  45.28 
 
 
212 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  44.95 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  44.78 
 
 
208 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  44.5 
 
 
220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  43.81 
 
 
204 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  44.55 
 
 
212 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  44.55 
 
 
212 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  44.55 
 
 
212 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  43.14 
 
 
213 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  40.7 
 
 
220 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  40.18 
 
 
224 aa  138  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  40 
 
 
222 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  39.09 
 
 
224 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  38.58 
 
 
216 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  36.22 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  31.34 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  32.86 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.24 
 
 
265 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  32.97 
 
 
227 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  35.83 
 
 
237 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  32.07 
 
 
234 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  30.32 
 
 
264 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  32.49 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  32.8 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  34.25 
 
 
190 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  34.25 
 
 
180 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.83 
 
 
181 aa  99  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  28.99 
 
 
303 aa  98.6  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.38 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34.24 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 
181 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  35.29 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  31.02 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  29.67 
 
 
180 aa  92.4  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  30.1 
 
 
216 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  33.16 
 
 
213 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  29.19 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  31.5 
 
 
428 aa  91.3  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  35.29 
 
 
220 aa  91.3  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  32.79 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  28.04 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  30.98 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>