33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0952 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  98.61 
 
 		 502 aa  1038    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1046    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  97.61 
 
 		 502 aa  1025    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  52.3 
 
 		 506 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  25 
 
 		 488 aa  127  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  22.89 
 
 		 528 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  27.18 
 
 		 564 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  25.95 
 
 		 534 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.33 
 
 		 534 aa  90.5  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  21.47 
 
 		 520 aa  87  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  21.08 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.51 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  27.01 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  20.16 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  25.89 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  25.57 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  25.71 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.51 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  25.66 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.35 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.66 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.09 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  24.28 
 
 		 519 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  24.43 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.73 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.97 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.87 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.45 
 
 		 540 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.04 
 
 		 555 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.45 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25 
 
 		 533 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.27 
 
 		 511 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  22.57 
 
 		 525 aa  47  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>