More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0720 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  71.95 
 
 		 257 aa  363  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  64.46 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  64.9 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  64.88 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  63.45 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  62.65 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  61.45 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  61.73 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  62.14 
 
 		 263 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  61.73 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  60.41 
 
 		 256 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  60.41 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  60.41 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  61.07 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  64.49 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  62.73 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  39.92 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  37.05 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  38.67 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  33.47 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  32.48 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1719  GntR domain-containing protein  37.2 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  hitchhiker  0.00929417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  34.21 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  35.06 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  35.06 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  29.36 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  31.06 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  29.34 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  28.51 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  30.47 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  29.72 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  31.47 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  30.17 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  32.75 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  32.74 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.58 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  30.96 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.63 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4400  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367956  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  31.22 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  30.51 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  29.41 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32.02 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  30.08 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  31.38 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  31.2 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  30.51 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 366 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  30.51 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  30.51 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.58 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  28.15 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  28.15 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  28.15 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  28.15 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 318 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.02 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  34.48 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  31.92 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  28.99 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.2 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>