82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0381 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  99.08 
 
 
327 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  100 
 
 
327 aa  673    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  99.08 
 
 
327 aa  668    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  100 
 
 
327 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.61941 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  100 
 
 
327 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  40.75 
 
 
328 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  40.23 
 
 
328 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  31.66 
 
 
345 aa  165  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  34.54 
 
 
336 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  40.83 
 
 
325 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  34.57 
 
 
327 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  30.31 
 
 
326 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  31.56 
 
 
324 aa  152  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  30.77 
 
 
332 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  30.77 
 
 
332 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  32.18 
 
 
332 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  29.43 
 
 
328 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  30 
 
 
332 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  33.22 
 
 
336 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  30.77 
 
 
332 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  30 
 
 
332 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  30 
 
 
332 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  30.33 
 
 
332 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  32 
 
 
332 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  34.56 
 
 
336 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  30 
 
 
332 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  32.46 
 
 
356 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  30.23 
 
 
362 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  30.42 
 
 
333 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  36.43 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  33.99 
 
 
339 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  31.82 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  30.94 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  34.68 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  35.27 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  34.85 
 
 
325 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  34.85 
 
 
325 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  28.03 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  34.57 
 
 
325 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  32.52 
 
 
328 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  28.06 
 
 
332 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  28.96 
 
 
371 aa  99  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  27.21 
 
 
318 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  28.11 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  30.48 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  30.94 
 
 
334 aa  86.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  31.19 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  27.84 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  27.92 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  27.92 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  29.59 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  27.92 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  26.83 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  31.19 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  29.86 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  31.53 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  27.06 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.1 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  25.59 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  25.4 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  25.85 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  25 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  30 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  29.55 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  27.05 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  26.39 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  27.85 
 
 
287 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0959  general secretion pathway protein K  23.47 
 
 
318 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1011  general secretion pathway protein K  22.59 
 
 
318 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  25.37 
 
 
281 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3309  hypothetical protein  25.88 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  25.65 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  24.88 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  28.35 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3263  general secretion pathway protein K  22.35 
 
 
318 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000006292  hitchhiker  0.00000000000000735036 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  25.82 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  23.58 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  23.11 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  24.54 
 
 
586 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  23.33 
 
 
361 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  23.44 
 
 
312 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  24.88 
 
 
297 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>