More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0097 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  99.3 
 
 
143 aa  290  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  93.71 
 
 
143 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  93.71 
 
 
143 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  93.71 
 
 
143 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  93.71 
 
 
143 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  93.71 
 
 
143 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  84.62 
 
 
143 aa  254  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  71.33 
 
 
144 aa  213  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  65.73 
 
 
144 aa  203  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  65.73 
 
 
144 aa  203  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  65.73 
 
 
144 aa  203  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  68.53 
 
 
143 aa  202  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  67.13 
 
 
143 aa  197  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  66.43 
 
 
143 aa  196  8e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  63.64 
 
 
143 aa  190  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  49.66 
 
 
148 aa  156  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0174  rhodanese domain-containing protein  48.25 
 
 
143 aa  155  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  48.95 
 
 
144 aa  151  3e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  50.35 
 
 
144 aa  150  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  49.65 
 
 
144 aa  145  2e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  48.25 
 
 
144 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 
170 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  43.36 
 
 
144 aa  135  3e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  44.76 
 
 
144 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  44.76 
 
 
144 aa  133  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  45.45 
 
 
144 aa  132  1e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 
144 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63421e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 
158 aa  130  4e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03873e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  43.36 
 
 
144 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 
144 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  40.56 
 
 
144 aa  127  4e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  44.29 
 
 
145 aa  126  8e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  46.46 
 
 
130 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 
142 aa  119  1e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  39.72 
 
 
141 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 
149 aa  116  1e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.23958e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  41.26 
 
 
149 aa  115  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  40.43 
 
 
141 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  40.56 
 
 
144 aa  112  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  40.56 
 
 
149 aa  113  1e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  43.97 
 
 
141 aa  112  2e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  43.06 
 
 
144 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  42.66 
 
 
145 aa  106  9e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
146 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  43.2 
 
 
144 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  39.72 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  38.73 
 
 
137 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.46 
 
 
141 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  3.98103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  34.27 
 
 
144 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  34.27 
 
 
141 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.37 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  46.15 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  36.17 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  35.25 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.71 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  35.25 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  30.94 
 
 
141 aa  82.4  2e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  42.16 
 
 
137 aa  82  2e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  42.16 
 
 
137 aa  82  2e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  42.16 
 
 
137 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
146 aa  81.3  4e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
140 aa  80.5  7e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  35.04 
 
 
140 aa  80.5  7e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
140 aa  80.5  8e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  37.23 
 
 
132 aa  79.7  1e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
140 aa  80.1  1e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
140 aa  79.7  1e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 
137 aa  78.2  3e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  34.4 
 
 
140 aa  77.8  4e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  39.22 
 
 
141 aa  77  9e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 
141 aa  76.3  1e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 
140 aa  76.3  2e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  27.54 
 
 
141 aa  74.3  5e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  27.54 
 
 
141 aa  74.3  5e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37 
 
 
138 aa  74.3  6e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  34.4 
 
 
135 aa  72.4  2e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  38.46 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  33.6 
 
 
135 aa  71.2  5e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  33.6 
 
 
135 aa  71.2  5e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  33.6 
 
 
135 aa  71.2  5e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  33.6 
 
 
135 aa  71.2  5e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  33.6 
 
 
135 aa  71.2  5e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  33.6 
 
 
135 aa  71.2  5e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  33.6 
 
 
135 aa  71.2  5e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  35.58 
 
 
137 aa  70.5  7e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
161 aa  70.5  8e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  33.82 
 
 
149 aa  70.1  1e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>