More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0095 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  91.57 
 
 
427 aa  735  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  852  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  91.57 
 
 
427 aa  704  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  91.57 
 
 
427 aa  735  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  852  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  852  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  99.77 
 
 
427 aa  850  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  99.76 
 
 
419 aa  833  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  99.76 
 
 
419 aa  833  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  99.76 
 
 
419 aa  833  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  100 
 
 
419 aa  835  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  835  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  88.29 
 
 
427 aa  712  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  91.33 
 
 
427 aa  731  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  91.8 
 
 
427 aa  737  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  66.25 
 
 
433 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  62.92 
 
 
456 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  63.4 
 
 
456 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  62.92 
 
 
456 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  63.3 
 
 
424 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  63.74 
 
 
444 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  66.25 
 
 
433 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  64.29 
 
 
424 aa  453  1e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  39.8 
 
 
410 aa  266  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  42.75 
 
 
405 aa  266  5e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  34.55 
 
 
377 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  35.92 
 
 
377 aa  236  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  34.47 
 
 
378 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  33.92 
 
 
362 aa  233  4e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  33.33 
 
 
377 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  33.33 
 
 
377 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46051e-06 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  34.7 
 
 
382 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  34.34 
 
 
362 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  35.75 
 
 
375 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  33.92 
 
 
362 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  33.92 
 
 
362 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  33.86 
 
 
361 aa  223  5e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  34.35 
 
 
411 aa  222  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  33.41 
 
 
381 aa  222  1e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  34.49 
 
 
344 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  33.83 
 
 
379 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  33.33 
 
 
382 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  32.12 
 
 
378 aa  215  1e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  35.11 
 
 
363 aa  214  2e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  31.57 
 
 
377 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  1.59575e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  34.07 
 
 
377 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  33.92 
 
 
416 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  32.09 
 
 
428 aa  201  2e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  35.63 
 
 
420 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  29.54 
 
 
374 aa  189  6e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  31.41 
 
 
387 aa  189  6e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  31.31 
 
 
434 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  33.73 
 
 
381 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  31.79 
 
 
426 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  32.69 
 
 
428 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  31.01 
 
 
417 aa  180  3e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  30.99 
 
 
440 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  30.68 
 
 
441 aa  175  2e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  32.71 
 
 
438 aa  173  6e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  32.04 
 
 
412 aa  173  6e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  31.69 
 
 
438 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  29.66 
 
 
413 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  30.33 
 
 
366 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  30.09 
 
 
438 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  32.99 
 
 
432 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  29.17 
 
 
369 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  33.64 
 
 
405 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  27.7 
 
 
379 aa  164  4e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  32.97 
 
 
387 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  31.47 
 
 
411 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  28.11 
 
 
398 aa  152  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  27.75 
 
 
380 aa  152  9e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  33.07 
 
 
382 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  28.01 
 
 
380 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  26.44 
 
 
477 aa  149  1e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  30.53 
 
 
436 aa  149  1e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  30.53 
 
 
436 aa  148  2e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  26.76 
 
 
397 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  25.26 
 
 
404 aa  140  5e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.21707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.42 
 
 
398 aa  137  3e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.18753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  25.79 
 
 
397 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  24.7 
 
 
396 aa  132  1e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.44038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  27.46 
 
 
405 aa  132  2e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.58 
 
 
391 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5868  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  26.79 
 
 
394 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  25.12 
 
 
375 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.19165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  26.73 
 
 
402 aa  109  9e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  25.3 
 
 
374 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.67566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.06 
 
 
379 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  26.74 
 
 
397 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  26.57 
 
 
376 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  32.13 
 
 
301 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  25 
 
 
399 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  26.17 
 
 
400 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  25 
 
 
399 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  23.53 
 
 
441 aa  99.8  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  44.44 
 
 
230 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.39661e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  23.88 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  27.49 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>