More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0093 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  100 
 
 
344 aa  721  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  99.42 
 
 
344 aa  717  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  99.71 
 
 
344 aa  717  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  97.97 
 
 
344 aa  707  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  98.84 
 
 
344 aa  712  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  721  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
344 aa  721  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  100 
 
 
344 aa  721  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  80.47 
 
 
344 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  80.47 
 
 
344 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  80.47 
 
 
344 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  80.17 
 
 
344 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  80.17 
 
 
344 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  48.75 
 
 
332 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  37.42 
 
 
327 aa  244  2e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.08 
 
 
329 aa  131  1e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.08 
 
 
329 aa  131  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.82 
 
 
326 aa  130  4e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  34.93 
 
 
319 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.68 
 
 
326 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.07 
 
 
326 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
341 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
324 aa  121  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
358 aa  121  2e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.62 
 
 
326 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.79 
 
 
322 aa  119  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
340 aa  117  2e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
326 aa  113  4e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.33 
 
 
326 aa  112  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
376 aa  112  1e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  30.14 
 
 
353 aa  112  1e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
333 aa  112  1e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
289 aa  110  2e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  25.88 
 
 
325 aa  110  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  31.9 
 
 
346 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  42.74 
 
 
334 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
384 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.28 
 
 
323 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.25 
 
 
970 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  28.33 
 
 
358 aa  100  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  43.4 
 
 
785 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
324 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
343 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  34.95 
 
 
1173 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
1116 aa  99.8  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  47.87 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.16 
 
 
1168 aa  99.4  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  31.52 
 
 
333 aa  99  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  41.44 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  35.65 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.45 
 
 
275 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  44.44 
 
 
697 aa  96.7  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
303 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  43.14 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  38.74 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  30.88 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  27.64 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  42.61 
 
 
616 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.16 
 
 
1157 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  42.98 
 
 
1148 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
390 aa  92.8  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  43.62 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  38.05 
 
 
325 aa  92.4  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  1.2927e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  26.59 
 
 
386 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
390 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.7 
 
 
328 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  28.32 
 
 
301 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
348 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  3.43006e-07 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  30.45 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 
351 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.26958e-07 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  37.93 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 
689 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
369 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.81 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
335 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  48.31 
 
 
301 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  33.09 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  25.62 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  33.09 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14580  glycosyl transferase  29.93 
 
 
636 aa  89.7  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 
373 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
330 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.20628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  48.35 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 
597 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  31.77 
 
 
1169 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>