More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0080 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  99.2 
 
 
374 aa  776    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  89.84 
 
 
374 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  99.2 
 
 
374 aa  776    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.04 
 
 
374 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  88.5 
 
 
374 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.3 
 
 
374 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  98.93 
 
 
374 aa  771    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  98.93 
 
 
374 aa  773    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  98.93 
 
 
374 aa  774    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.3 
 
 
374 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.04 
 
 
374 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  781    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  98.93 
 
 
374 aa  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  99.2 
 
 
374 aa  775    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  59.24 
 
 
371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  51.89 
 
 
373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  51.62 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  51.62 
 
 
374 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  51.63 
 
 
373 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  51.74 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  51.63 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  52.28 
 
 
374 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  51.74 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  51.63 
 
 
374 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  50.54 
 
 
374 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
373 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  44.62 
 
 
378 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  46.26 
 
 
377 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  38.84 
 
 
391 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  38.11 
 
 
364 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 
372 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  36.86 
 
 
371 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
373 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
366 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
369 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
361 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
386 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
372 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
372 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
381 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
375 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  27.13 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.18 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.13 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  25.41 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
434 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  29.12 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  34.55 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  29.12 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.51 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  25.28 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  34.15 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4915  hypothetical protein  28.31 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.327888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.32 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  30.51 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  24.23 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  29.37 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
1261 aa  66.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>