More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0079 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  99.41 
 
 
352 aa  703  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 
340 aa  706  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  1.04869e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 
352 aa  706  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  99.71 
 
 
340 aa  704  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  99.12 
 
 
352 aa  701  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 
352 aa  706  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.96072e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 
340 aa  706  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  99.71 
 
 
352 aa  704  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  73.27 
 
 
356 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  71.08 
 
 
356 aa  505  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  71.08 
 
 
356 aa  505  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  69.41 
 
 
356 aa  504  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  71.08 
 
 
356 aa  505  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  71.08 
 
 
356 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  50.29 
 
 
356 aa  331  9e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  45.95 
 
 
360 aa  306  4e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  4.41962e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  39.07 
 
 
389 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  40.83 
 
 
397 aa  220  2e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  40.83 
 
 
387 aa  221  2e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  40.53 
 
 
387 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  38.6 
 
 
361 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.92 
 
 
367 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  35.69 
 
 
361 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  35.71 
 
 
361 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  36.03 
 
 
367 aa  179  6e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.03 
 
 
352 aa  165  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  31.76 
 
 
370 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  32.76 
 
 
348 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.57 
 
 
356 aa  129  8e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  29 
 
 
356 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.33 
 
 
356 aa  127  4e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29.41 
 
 
458 aa  120  5e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.82 
 
 
359 aa  117  2e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.17 
 
 
390 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.17 
 
 
390 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.17 
 
 
390 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.17 
 
 
390 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.15 
 
 
350 aa  114  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.17 
 
 
390 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.17 
 
 
390 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  27.86 
 
 
394 aa  111  1e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.85 
 
 
392 aa  110  4e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
402 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.38 
 
 
339 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
475 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
404 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
392 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
386 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
392 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
392 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  28.72 
 
 
330 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  26.55 
 
 
344 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
403 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  27.52 
 
 
369 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  26.88 
 
 
348 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 
360 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
390 aa  99.4  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.89 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  27.51 
 
 
385 aa  96.3  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.79 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  26.99 
 
 
330 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  21.3 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
347 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.92 
 
 
343 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0391  glycosyl transferase family 9  25.91 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0900723  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  20.71 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  30 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  20.9 
 
 
340 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
326 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.46 
 
 
516 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 
354 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  22.46 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  21.49 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  25.09 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1800  LPS heptosyltransferase-like  25.42 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  22.1 
 
 
347 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  26.46 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  21.53 
 
 
359 aa  86.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.79 
 
 
371 aa  85.9  1e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  21.08 
 
 
342 aa  85.5  1e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  25.81 
 
 
350 aa  85.5  1e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
409 aa  84.3  2e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  26.99 
 
 
362 aa  84.7  2e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  26.26 
 
 
339 aa  84  3e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  21.39 
 
 
347 aa  84  4e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  25.61 
 
 
352 aa  83.6  5e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 
350 aa  83.6  5e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  1.36303e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.72 
 
 
357 aa  82.8  7e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
390 aa  82.8  7e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  26.3 
 
 
408 aa  82.4  9e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 
357 aa  82  1e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
351 aa  81.3  2e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.51 
 
 
349 aa  81.6  2e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.13 
 
 
779 aa  81.3  2e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.85158e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>