258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0075 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03493  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3926  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0224319  hitchhiker  0.00115915 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.65182e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3971  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.10217e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.92667e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  8.11631e-07  hitchhiker  1.27096e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  9.95391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.49114e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
55 aa  111  4e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.29563e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  98.18 
 
 
55 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.72233e-06  hitchhiker  3.24961e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  98.18 
 
 
55 aa  110  7e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  96.36 
 
 
55 aa  110  8e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  96.36 
 
 
55 aa  109  1e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  96.36 
 
 
55 aa  109  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.658e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  96.36 
 
 
55 aa  109  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.65361e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  96.36 
 
 
55 aa  109  1e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  94.55 
 
 
55 aa  108  2e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0161  ribosomal protein L33  92.73 
 
 
55 aa  107  7e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.490413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 
55 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2022  ribosomal protein L33  94.12 
 
 
51 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.44183e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2600  50S ribosomal protein L33  83.64 
 
 
55 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.19047e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  95.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0329  50S ribosomal protein L33  85.19 
 
 
57 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.23722e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3479  50S ribosomal protein L33  85.19 
 
 
57 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020759  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0464  50S ribosomal protein L33  85.19 
 
 
57 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 
55 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  7.60061e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145a  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
56 aa  94.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00313343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2340  50S ribosomal protein L33  86.27 
 
 
51 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00655  50S ribosomal protein L33  83.02 
 
 
56 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001819  LSU ribosomal protein L33p  83.02 
 
 
56 aa  93.6  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  8.10994e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.14738e-05  hitchhiker  5.58553e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.34735e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
57 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  3.3956e-06  hitchhiker  1.14944e-10 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  81.48 
 
 
57 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  1.05802e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  81.48 
 
 
57 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  81.48 
 
 
57 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  4.73608e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6091  50S ribosomal protein L33  86.27 
 
 
51 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70180  50S ribosomal protein L33  86.27 
 
 
51 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  81.48 
 
 
57 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1996  ribosomal protein L33  77.78 
 
 
56 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.76258  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2641  ribosomal protein L33  84.31 
 
 
51 aa  90.5  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  75.93 
 
 
56 aa  90.5  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.11792e-08 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  80.39 
 
 
51 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1453  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  90.5  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.7102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0977  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1022  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.209918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0982  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.392597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2101  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.278945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2648  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0583  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0779  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0792  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.696109  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2324  50S ribosomal protein L33  77.78 
 
 
56 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2714  50S ribosomal protein L33  77.78 
 
 
56 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0311  50S ribosomal protein L33  80.39 
 
 
51 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000251757  normal  0.219497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2446  50S ribosomal protein L33  77.78 
 
 
56 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 
55 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0210  50S ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.088727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  82.35 
 
 
51 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  80.39 
 
 
51 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 
55 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.78074e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0090  ribosomal protein L33  80.39 
 
 
51 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0225  50S ribosomal protein L33  80.39 
 
 
51 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2590  50S ribosomal protein L33P  74.55 
 
 
55 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.493665  normal  0.155202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0588  50S ribosomal protein L33  80.39 
 
 
51 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.696444  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2734  50S ribosomal protein L33  75.93 
 
 
56 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2871  50S ribosomal protein L33  75.93 
 
 
56 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654658  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1990  50S ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  74.07 
 
 
56 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 
55 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1711  50S ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  76.47 
 
 
51 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0054  50S ribosomal protein L33  76.47 
 
 
51 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.505038  normal  0.0539587 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0178  ribosomal protein L33  90.91 
 
 
55 aa  84  6e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2140  ribosomal protein L33  78.43 
 
 
51 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>