80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0058 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03511  glutamate transporter  100 
 
 
401 aa  790  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3963  sodium/glutamate symporter  92.77 
 
 
401 aa  645  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3953  sodium/glutamate symporter  93 
 
 
401 aa  644  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4072  sodium/glutamate symporter  92.77 
 
 
401 aa  645  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4026  sodium/glutamate symporter  93.02 
 
 
401 aa  647  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4104  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
401 aa  790  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0058  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
401 aa  790  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3988  sodium/glutamate symporter  99.5 
 
 
401 aa  788  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3864  sodium/glutamate symporter  99.75 
 
 
401 aa  788  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4157  sodium/glutamate symporter  99.75 
 
 
401 aa  788  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4132  sodium/glutamate symporter  93.25 
 
 
401 aa  646  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0214352  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5026  sodium/glutamate symporter  99.75 
 
 
401 aa  788  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03463  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  790  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0052  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
401 aa  790  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  82.71 
 
 
404 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  82.46 
 
 
404 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  82.46 
 
 
404 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4872  sodium/glutamate symporter  81.2 
 
 
403 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854487  normal  0.0119787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0996  sodium/glutamate symporter  69.17 
 
 
401 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1033  sodium/glutamate symporter  67.92 
 
 
401 aa  465  1e-130  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4228  sodium/glutamate symporter  68.92 
 
 
401 aa  461  1e-128  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0724268  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0995  sodium/glutamate symporter  68.03 
 
 
401 aa  454  1e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  53.88 
 
 
404 aa  407  1e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  53.83 
 
 
402 aa  405  1e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  5.67531e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  54.29 
 
 
409 aa  398  1e-110  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0916  sodium/glutamate symport carrier protein  59.4 
 
 
402 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.920005  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  52.24 
 
 
424 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4718  sodium/glutamate symporter  51.53 
 
 
401 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  51 
 
 
424 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2020  sodium/glutamate symporter  53.6 
 
 
412 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.733127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  51.51 
 
 
404 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  51.51 
 
 
404 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  48.21 
 
 
408 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2389  sodium/glutamate symporter  47.76 
 
 
407 aa  347  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.657227  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  46.8 
 
 
417 aa  345  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  46.72 
 
 
428 aa  345  6e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3251  sodium/glutamate symporter  47.37 
 
 
407 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  47.49 
 
 
407 aa  345  7e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2923  sodium/glutamate symporter  46.59 
 
 
407 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4778  sodium/glutamate symporter  47.89 
 
 
407 aa  342  6e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.4689e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  46.29 
 
 
407 aa  342  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  46.23 
 
 
407 aa  340  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  47.39 
 
 
407 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4777  sodium/glutamate symporter  47.52 
 
 
407 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.31093e-08 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07017  hypothetical protein  47.37 
 
 
420 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0118  sodium/glutamate symporter  47.39 
 
 
407 aa  332  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1541  sodium/glutamate symporter  46.83 
 
 
407 aa  325  8e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1482  sodium/glutamate symporter  46.34 
 
 
407 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.485218  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1547  sodium/glutamate symporter  46.59 
 
 
407 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2684  sodium/glutamate symporter  46.34 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1682  sodium/glutamate symporter  46.34 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00781316  normal  0.0287357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2705  sodium/glutamate symporter  46.34 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2781  sodium/glutamate symporter  46.34 
 
 
407 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.689609  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2697  sodium/glutamate symporter  46.97 
 
 
407 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000968  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
361 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0092  sodium/glutamate symporter  46.77 
 
 
408 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.11115e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  35.73 
 
 
409 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0244  sodium/glutamate symporter  37.94 
 
 
392 aa  261  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1355  sodium-glutamate symporter  34.16 
 
 
409 aa  259  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1451  sodium/glutamate symporter  34.33 
 
 
414 aa  259  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2643  sodium/glutamate symporter  42.5 
 
 
402 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2504  sodium/glutamate symporter  38.69 
 
 
398 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  37.47 
 
 
400 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  36.95 
 
 
402 aa  256  7e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4118  hypothetical protein  37.08 
 
 
401 aa  254  1e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.601595  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1050  sodium/glutamate symporter  40.05 
 
 
398 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0733546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0831  sodium/glutamate symporter  40.1 
 
 
402 aa  245  1e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  38.99 
 
 
402 aa  244  2e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  38.99 
 
 
402 aa  244  2e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0496  sodium/glutamate symporter  35.71 
 
 
392 aa  241  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1261  sodium/glutamate symporter  39.85 
 
 
402 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  34.16 
 
 
414 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3454  sodium/glutamate symporter  37.94 
 
 
401 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890755  normal  0.830149 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0361  transporter, putative  32.44 
 
 
457 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  5.37763e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4810  sodium/glutamate symporter  37.59 
 
 
399 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1953  sodium/glutamate symporter  39.29 
 
 
404 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00992782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23160  sodium/glutamate symporter  40.15 
 
 
404 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  9.9413e-05 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  23.59 
 
 
471 aa  52  2e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  26.75 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  25.4 
 
 
471 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>