26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0056 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03513  hypothetical protein  99.47 
 
 
569 aa  1145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3990  AsmA family protein  98.42 
 
 
569 aa  1135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4106  AsmA family protein  99.12 
 
 
569 aa  1140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4028  AsmA family protein  80.6 
 
 
569 aa  936  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4074  AsmA family protein  80.25 
 
 
559 aa  913  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3955  AsmA family protein  80.42 
 
 
569 aa  932  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3965  AsmA family protein  80.25 
 
 
569 aa  932  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4134  AsmA family protein  80.42 
 
 
569 aa  935  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5028  AsmA family protein  98.95 
 
 
569 aa  1142  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0056  AsmA family protein  100 
 
 
569 aa  1150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.21174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0072  AsmA family protein  72.13 
 
 
573 aa  852  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.11824  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4159  AsmA family protein  99.12 
 
 
569 aa  1142  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3866  AsmA family protein  100 
 
 
569 aa  1150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0050  AsmA family protein  99.47 
 
 
569 aa  1145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4215  AsmA family protein  51.07 
 
 
564 aa  603  1e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3954  AsmA family protein  49.56 
 
 
575 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4498  AsmA family protein  50.27 
 
 
563 aa  593  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4874  AsmA family protein  51.09 
 
 
553 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000517487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4151  AsmA family protein  48.84 
 
 
582 aa  582  1e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4183  AsmA family protein  49.02 
 
 
569 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0033  asmA family protein  49.02 
 
 
569 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0038  asmA family protein  49.2 
 
 
569 aa  568  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001897  hypothetical protein  21.46 
 
 
692 aa  112  2e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00596  hypothetical protein  23.67 
 
 
731 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2929  hypothetical protein  19.58 
 
 
660 aa  88.6  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2311  hypothetical protein  22.02 
 
 
628 aa  81.3  5e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>