32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0050 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  76.25 
 
 		 81 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  61.25 
 
 		 87 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  52.05 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  51.95 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  46.25 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  47.76 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  47.76 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  47.76 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  49.15 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  47.76 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  60.78 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  50 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  54.55 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  48.44 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  54.9 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  54.9 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  54.9 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  54.9 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  54.9 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  54.55 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1060  transcriptional activator Ogr/delta  52.38 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  38.81 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  38.81 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  38.81 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  38.81 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  35.59 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  40.68 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  39.51 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  39.06 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0384  putative activator encoded in prophage CP-933I  47.5 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.223602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  46.34 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>