198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0040 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  99.67 
 
 
307 aa  601  1e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 
307 aa  603  1e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  99.02 
 
 
307 aa  599  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  99.35 
 
 
307 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  99.35 
 
 
307 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  99.35 
 
 
307 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  99.02 
 
 
307 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  98.05 
 
 
307 aa  593  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  98.66 
 
 
299 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.6 
 
 
315 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.26 
 
 
315 aa  506  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.26 
 
 
315 aa  506  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.26 
 
 
315 aa  506  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.26 
 
 
315 aa  506  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  84.56 
 
 
301 aa  492  1e-138  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  37.73 
 
 
297 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  38.59 
 
 
300 aa  188  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 
303 aa  185  1e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  7.978e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 
314 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.23708e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  34.88 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  36.45 
 
 
308 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  35.69 
 
 
310 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  34.11 
 
 
308 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  35.25 
 
 
308 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  34.11 
 
 
308 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  34.55 
 
 
308 aa  167  3e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  34.11 
 
 
308 aa  167  3e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  34.32 
 
 
308 aa  165  1e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  34 
 
 
300 aa  163  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  34.8 
 
 
306 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  33.22 
 
 
309 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  6.99147e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  32.87 
 
 
299 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  37.14 
 
 
304 aa  159  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  8.14807e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.35 
 
 
308 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  33.9 
 
 
296 aa  157  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  33.99 
 
 
304 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  33.45 
 
 
299 aa  152  9e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  32.48 
 
 
319 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  33.79 
 
 
296 aa  150  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  30.77 
 
 
322 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  32.59 
 
 
322 aa  147  2e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.59 
 
 
309 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  33.76 
 
 
322 aa  141  2e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
331 aa  141  2e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  33.78 
 
 
295 aa  140  4e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 
293 aa  139  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
321 aa  139  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  30.34 
 
 
290 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  28.71 
 
 
325 aa  138  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  29.1 
 
 
297 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.00378e-06  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  30.69 
 
 
290 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  33.46 
 
 
320 aa  134  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  33.46 
 
 
320 aa  134  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
530 aa  134  2e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  31.53 
 
 
321 aa  131  1e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 
313 aa  131  2e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  32.13 
 
 
322 aa  129  5e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  29.47 
 
 
322 aa  129  7e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  29.78 
 
 
322 aa  129  7e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  29.47 
 
 
322 aa  129  7e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  29.47 
 
 
322 aa  129  7e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  28.14 
 
 
305 aa  128  1e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  29.18 
 
 
304 aa  127  2e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  29.57 
 
 
321 aa  120  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 
520 aa  116  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  1.66292e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  28.12 
 
 
358 aa  113  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.61 
 
 
315 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 
310 aa  99.4  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.29 
 
 
297 aa  80.5  3e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.3 
 
 
308 aa  76.3  6e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 
309 aa  75.1  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
297 aa  72  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  30.43 
 
 
150 aa  70.5  4e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  24.39 
 
 
294 aa  67.8  2e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.28 
 
 
323 aa  66.2  7e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  24.34 
 
 
294 aa  63.9  3e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.26 
 
 
317 aa  62.8  7e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
348 aa  62  1e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.25 
 
 
305 aa  60.8  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.02 
 
 
302 aa  61.2  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
278 aa  60.1  5e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  25.16 
 
 
308 aa  59.7  6e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  28.8 
 
 
318 aa  59.7  7e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  25.71 
 
 
301 aa  59.3  7e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
310 aa  59.3  8e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 
325 aa  59.3  8e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 
321 aa  57.8  2e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.17632e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.16 
 
 
315 aa  57.4  3e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  24.07 
 
 
304 aa  56.6  5e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  26.16 
 
 
357 aa  56.6  5e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 
317 aa  56.2  6e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  24.37 
 
 
310 aa  56.2  6e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  26.24 
 
 
301 aa  55.1  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  23.43 
 
 
301 aa  55.5  1e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.05 
 
 
308 aa  54.3  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  23.9 
 
 
301 aa  54.7  2e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  23.9 
 
 
301 aa  53.9  3e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.38 
 
 
296 aa  54.3  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.05 
 
 
304 aa  53.9  3e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.96 
 
 
303 aa  53.9  4e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.31242e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>