More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0039 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0039  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3873  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03544  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  99.26 
 
 
272 aa  550  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  99.63 
 
 
272 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4016  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  99.26 
 
 
272 aa  551  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.651354  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4168  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  99.63 
 
 
272 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03486  hypothetical protein  99.26 
 
 
272 aa  550  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4116  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  98.53 
 
 
272 aa  544  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0742418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  97.06 
 
 
272 aa  512  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0046  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  86.35 
 
 
266 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256696  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  75.48 
 
 
271 aa  411  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1359  YaeC family lipoprotein  77.2 
 
 
270 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1776  lipoprotein, YaeC family  71.65 
 
 
271 aa  394  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  62.55 
 
 
271 aa  352  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  62.55 
 
 
271 aa  352  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  62.55 
 
 
271 aa  352  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  62.55 
 
 
271 aa  352  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  63.57 
 
 
271 aa  352  3e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  7.28433e-09  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  62.55 
 
 
271 aa  352  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.8 
 
 
271 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.8 
 
 
271 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  61.8 
 
 
271 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.8 
 
 
271 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.08912e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  61.8 
 
 
271 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  61.8 
 
 
271 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.34725e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.8 
 
 
271 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.8 
 
 
271 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  60.74 
 
 
271 aa  348  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.42 
 
 
271 aa  348  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  60.74 
 
 
271 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.24 
 
 
271 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  60.67 
 
 
271 aa  339  3e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.74258e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  60.47 
 
 
271 aa  339  3e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.24 
 
 
271 aa  335  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.24 
 
 
271 aa  335  6e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.14817e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  60.85 
 
 
271 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  56.98 
 
 
271 aa  319  4e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3984  YaeC family lipoprotein  57.14 
 
 
270 aa  297  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  54.41 
 
 
269 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.65 
 
 
269 aa  283  2e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01200  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.94 
 
 
269 aa  273  2e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3536  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  53.85 
 
 
271 aa  270  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784209  normal  0.0236747 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0427  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  55.88 
 
 
275 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1535  outer membrane lipoprotein 1 precursor  49.58 
 
 
276 aa  243  2e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  45.42 
 
 
267 aa  235  5e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.42 
 
 
267 aa  235  5e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  43.78 
 
 
275 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  8.12987e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  44.4 
 
 
259 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  45.8 
 
 
266 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  47.56 
 
 
268 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  8.1124e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  43.63 
 
 
259 aa  221  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  44.02 
 
 
259 aa  221  1e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  49.79 
 
 
262 aa  220  2e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  46.75 
 
 
268 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  8.95864e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1799  hypothetical protein  43.07 
 
 
259 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  46.75 
 
 
529 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1798  hypothetical protein  43.07 
 
 
259 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  47.66 
 
 
260 aa  214  1e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  41.41 
 
 
286 aa  214  1e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  43.46 
 
 
271 aa  213  3e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  43.66 
 
 
271 aa  213  3e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  44.03 
 
 
271 aa  213  4e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  44.03 
 
 
271 aa  213  4e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  42.53 
 
 
264 aa  212  5e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  48.12 
 
 
265 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  46.25 
 
 
269 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  43.28 
 
 
271 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  43.28 
 
 
271 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  43.28 
 
 
271 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  40.36 
 
 
271 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  44.4 
 
 
281 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.4 
 
 
272 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  44.35 
 
 
259 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.4 
 
 
272 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.4 
 
 
272 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.4 
 
 
272 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.72 
 
 
270 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.4 
 
 
272 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3792  YaeC family lipoprotein  43.02 
 
 
265 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.38 
 
 
270 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  43.98 
 
 
264 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  43.32 
 
 
270 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  45.64 
 
 
272 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  46.47 
 
 
266 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  46.47 
 
 
266 aa  205  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  43.98 
 
 
272 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  47.13 
 
 
264 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  47.13 
 
 
264 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  46.72 
 
 
264 aa  204  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.32 
 
 
268 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  46.72 
 
 
264 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  45.66 
 
 
281 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  46.31 
 
 
264 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  45.75 
 
 
260 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.57 
 
 
272 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  39.08 
 
 
281 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.29064e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  42.92 
 
 
279 aa  201  1e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  46.03 
 
 
265 aa  201  1e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  46.03 
 
 
265 aa  201  1e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  42.98 
 
 
262 aa  201  1e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>