19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0036 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0036  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  6e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0040  protein of unknown function DUF1198  100 
 
 
150 aa  306  6e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5092  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  6e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0192931 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4256  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  6e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3876  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  6e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4171  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  6e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4028  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  306  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.484011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03547  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  306  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03489  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  306  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4175  hypothetical protein  82.67 
 
 
150 aa  266  9e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4012  hypothetical protein  82.67 
 
 
150 aa  266  9e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3996  hypothetical protein  82.67 
 
 
150 aa  266  9e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4117  hypothetical protein  82.67 
 
 
150 aa  266  9e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4067  hypothetical protein  82.67 
 
 
150 aa  266  9e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0031  hypothetical protein  70 
 
 
150 aa  234  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.836828  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1068  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000789019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3543  hypothetical protein  32.19 
 
 
149 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.10645e-06  hitchhiker  0.00337503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1122  hypothetical protein  32.19 
 
 
149 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.53856e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3709  hypothetical protein  29.05 
 
 
148 aa  79.3  2e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>