More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0032 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  88.33 
 
 
442 aa  778  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  90.87 
 
 
442 aa  795  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  84.79 
 
 
447 aa  747  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  99.09 
 
 
439 aa  876  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  90.87 
 
 
442 aa  799  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  100 
 
 
439 aa  883  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  90.87 
 
 
442 aa  799  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  90.87 
 
 
442 aa  798  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  99.77 
 
 
439 aa  880  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  99.77 
 
 
439 aa  880  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  99.54 
 
 
439 aa  879  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  99.54 
 
 
439 aa  878  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  99.77 
 
 
439 aa  880  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  90.87 
 
 
442 aa  798  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  99.77 
 
 
439 aa  880  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  99.77 
 
 
439 aa  882  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  64.68 
 
 
443 aa  602  1e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  63.24 
 
 
446 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  65.67 
 
 
453 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  65.21 
 
 
443 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  65.44 
 
 
443 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  59.09 
 
 
436 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  53.44 
 
 
446 aa  494  1e-138  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 
441 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  54.94 
 
 
422 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  55.31 
 
 
433 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  52.52 
 
 
437 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  53.09 
 
 
434 aa  415  1e-115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  47.5 
 
 
456 aa  400  1e-110  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  48.62 
 
 
455 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  48.85 
 
 
455 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  40.19 
 
 
440 aa  328  1e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.186527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2389  regulatory protein UhpC  40.19 
 
 
440 aa  328  1e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.365654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2547  regulatory protein UhpC  40.19 
 
 
440 aa  328  1e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2437  regulatory protein UhpC  40.19 
 
 
440 aa  327  2e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2344  regulatory protein UhpC  40.19 
 
 
440 aa  327  2e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  37.89 
 
 
449 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.67094e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  37.44 
 
 
449 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.64698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  37.44 
 
 
449 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  37.84 
 
 
449 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  36.77 
 
 
449 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  37.84 
 
 
449 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70433e-14 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  37.84 
 
 
449 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  37.61 
 
 
449 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  37.61 
 
 
449 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.15527e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  38.07 
 
 
449 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.91973e-08  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  38.3 
 
 
449 aa  292  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.85 
 
 
449 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  37.56 
 
 
445 aa  285  1e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.36 
 
 
450 aa  285  2e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.16 
 
 
446 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  34.61 
 
 
445 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  34.61 
 
 
445 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.28 
 
 
452 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.28 
 
 
452 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.28 
 
 
452 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.28 
 
 
452 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.28 
 
 
452 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.05 
 
 
452 aa  275  1e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.05 
 
 
452 aa  275  1e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.05 
 
 
452 aa  275  1e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.05 
 
 
452 aa  275  1e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  38.05 
 
 
452 aa  275  1e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.05 
 
 
452 aa  275  1e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  38.05 
 
 
452 aa  275  1e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.05 
 
 
452 aa  275  2e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.05 
 
 
452 aa  275  2e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  35.73 
 
 
449 aa  273  5e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.67 
 
 
449 aa  273  5e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.11 
 
 
448 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  35.96 
 
 
449 aa  272  8e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.19 
 
 
483 aa  272  8e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.11 
 
 
448 aa  272  8e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.48 
 
 
450 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.77 
 
 
449 aa  270  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.88 
 
 
450 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.32 
 
 
455 aa  263  5e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.1 
 
 
449 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  8.7639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  34.37 
 
 
448 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  37.53 
 
 
452 aa  259  5e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.26 
 
 
451 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  35.73 
 
 
452 aa  259  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.30916e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  35.66 
 
 
454 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  37.33 
 
 
452 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.12087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  37.33 
 
 
452 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  34.47 
 
 
446 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  34.1 
 
 
444 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  35.6 
 
 
457 aa  253  4e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  33.95 
 
 
444 aa  253  5e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  33.03 
 
 
480 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  33.95 
 
 
444 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30179  MFS family transporter: hexose phosphate  38.07 
 
 
507 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0192578  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  33.69 
 
 
481 aa  250  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  6.1877e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  33.72 
 
 
444 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  33.72 
 
 
444 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  33.95 
 
 
444 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  33.72 
 
 
444 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  33.95 
 
 
444 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  33.49 
 
 
444 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  33.49 
 
 
444 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>