More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0029 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0029  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4037  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.662248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4179  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3883  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5103  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.094181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03496  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0033  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03554  acetolactate synthase small subunit  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4249  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4184  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  90.62 
 
 
96 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4021  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  90.62 
 
 
96 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4126  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  90.62 
 
 
96 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4076  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  90.62 
 
 
96 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4005  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  90.62 
 
 
96 aa  182  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0026  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  89.01 
 
 
95 aa  173  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0733  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  71.59 
 
 
97 aa  138  2e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.527542  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3814  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.04 
 
 
97 aa  134  3e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.77 
 
 
98 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0580  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60.64 
 
 
97 aa  132  2e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0286747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3625  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
103 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3075  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  55.21 
 
 
104 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0399  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.86 
 
 
121 aa  116  1e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1949  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.65 
 
 
115 aa  113  7e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2288  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.65 
 
 
115 aa  113  7e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1838  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.65 
 
 
115 aa  113  7e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  51.58 
 
 
103 aa  113  8e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1882  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  59.52 
 
 
121 aa  110  4e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2623  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  61.45 
 
 
115 aa  110  8e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1630  acetolactate synthase, small subunit  54.12 
 
 
96 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.582859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0157  amino acid-binding ACT domain-containing protein  57.75 
 
 
130 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  46.48 
 
 
167 aa  65.9  2e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
164 aa  65.1  3e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78252e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  47.83 
 
 
207 aa  65.5  3e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  42.25 
 
 
170 aa  63.5  1e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  37.08 
 
 
167 aa  61.2  4e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
165 aa  61.2  5e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
171 aa  60.8  6e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  37.21 
 
 
185 aa  60.8  7e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1709  acetolactate synthase, small subunit  40.58 
 
 
175 aa  59.7  1e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.66 
 
 
184 aa  60.1  1e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1164  acetolactate synthase, small subunit  43.48 
 
 
174 aa  59.7  1e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686831  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
172 aa  59.3  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
168 aa  59.3  2e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
174 aa  59.3  2e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
172 aa  58.9  3e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
174 aa  58.5  3e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2385  acetolactate synthase, small subunit  43.48 
 
 
173 aa  58.5  3e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
172 aa  58.2  4e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.14698e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.84 
 
 
172 aa  57.8  4e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  40.58 
 
 
174 aa  57.8  5e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.68 
 
 
176 aa  57.8  5e-08  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.14 
 
 
163 aa  57.8  5e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  36.36 
 
 
166 aa  57.4  6e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
167 aa  57.4  6e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
164 aa  57.4  7e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0904  acetolactate synthase, small subunit  36.36 
 
 
242 aa  57.4  7e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  42.03 
 
 
166 aa  57.4  7e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.21035e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
175 aa  57  8e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  39.13 
 
 
175 aa  57  8e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.71 
 
 
163 aa  57  9e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.67629e-09  hitchhiker  5.55489e-05 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  40.58 
 
 
167 aa  56.6  1e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  35.06 
 
 
170 aa  56.6  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.23689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
169 aa  56.6  1e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  38.67 
 
 
172 aa  56.6  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  38.67 
 
 
172 aa  56.6  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  37.68 
 
 
174 aa  56.6  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.14 
 
 
164 aa  56.6  1e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  33.72 
 
 
162 aa  56.2  1e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06130  acetolactate synthase, small subunit  38.03 
 
 
107 aa  55.5  2e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.547627  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.12 
 
 
161 aa  55.5  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  36.47 
 
 
161 aa  55.8  2e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
172 aa  55.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.84 
 
 
170 aa  56.2  2e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2768  acetolactate synthase, small subunit  33.73 
 
 
221 aa  55.8  2e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  34.88 
 
 
161 aa  55.8  2e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
174 aa  55.8  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.84 
 
 
172 aa  55.8  2e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  35.21 
 
 
164 aa  55.8  2e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.12 
 
 
171 aa  55.8  2e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  32.94 
 
 
165 aa  55.5  2e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
171 aa  55.5  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  7.78154e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
172 aa  55.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.71 
 
 
165 aa  55.1  3e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  38.03 
 
 
164 aa  55.5  3e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
162 aa  55.1  3e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
168 aa  55.1  3e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1336  acetolactate synthase, small subunit  40.58 
 
 
170 aa  54.7  4e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275336  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1043  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
184 aa  54.7  4e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.678602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  29.41 
 
 
169 aa  54.7  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  36.84 
 
 
172 aa  54.7  4e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.68 
 
 
176 aa  54.7  4e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
163 aa  54.7  4e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
161 aa  54.3  5e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  32.1 
 
 
166 aa  54.3  5e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.36695e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  34.88 
 
 
168 aa  54.7  5e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.23 
 
 
176 aa  54.3  5e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
163 aa  54.3  5e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.50238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.44 
 
 
168 aa  54.3  6e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  31.4 
 
 
161 aa  54.3  6e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.98092e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
164 aa  54.3  6e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>