More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0028 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  99.29 
 
 
562 aa  1149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  58.59 
 
 
605 aa  662  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  61.59 
 
 
563 aa  685  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  63.29 
 
 
556 aa  711  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  92.17 
 
 
562 aa  1068  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  92.17 
 
 
562 aa  1068  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  92.17 
 
 
562 aa  1068  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  92.17 
 
 
562 aa  1068  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  71.25 
 
 
554 aa  820  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  71.79 
 
 
554 aa  826  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  99.11 
 
 
562 aa  1146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  64.2 
 
 
555 aa  714  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  99.29 
 
 
562 aa  1149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  92.17 
 
 
562 aa  1068  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  99.29 
 
 
562 aa  1147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  70.71 
 
 
554 aa  805  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  75.53 
 
 
564 aa  869  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  100 
 
 
562 aa  1154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  99.11 
 
 
562 aa  1146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  71.07 
 
 
554 aa  816  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  100 
 
 
562 aa  1154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  99.29 
 
 
562 aa  1149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  86.48 
 
 
562 aa  1006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  69.57 
 
 
555 aa  796  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  98.58 
 
 
562 aa  1139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  69.57 
 
 
555 aa  796  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1631  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.7 
 
 
559 aa  632  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1883  acetolactate synthase catalytic subunit  58 
 
 
615 aa  631  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.32 
 
 
564 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.92 
 
 
548 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.74 
 
 
548 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.74 
 
 
548 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.74 
 
 
548 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.92 
 
 
548 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.92 
 
 
548 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.56 
 
 
548 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.73 
 
 
548 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.92 
 
 
548 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.12 
 
 
563 aa  511  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.92 
 
 
548 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.92 
 
 
548 aa  506  1e-142  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.2 
 
 
557 aa  506  1e-142  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  7.84156e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.29 
 
 
555 aa  508  1e-142  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.56 
 
 
548 aa  506  1e-142  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  46.74 
 
 
548 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  46.74 
 
 
548 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.2 
 
 
548 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.56 
 
 
548 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.65 
 
 
569 aa  504  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.65 
 
 
548 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.37 
 
 
548 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.64 
 
 
569 aa  494  1e-138  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.4 
 
 
558 aa  492  1e-138  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.83 
 
 
561 aa  494  1e-138  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.83 
 
 
556 aa  494  1e-138  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.76 
 
 
565 aa  494  1e-138  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.44 
 
 
555 aa  493  1e-138  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.87 
 
 
593 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.21 
 
 
588 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.2 
 
 
579 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.7 
 
 
612 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.42 
 
 
566 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.32944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.59 
 
 
568 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.09 
 
 
557 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  44.56 
 
 
583 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  44.91 
 
 
583 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.03 
 
 
552 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44 
 
 
587 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.03 
 
 
554 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  43.75 
 
 
562 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.78 
 
 
558 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.67 
 
 
561 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  47.06 
 
 
569 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  45.88 
 
 
567 aa  482  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.27 
 
 
573 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.65 
 
 
578 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.64 
 
 
563 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.91 
 
 
548 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.48 
 
 
558 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.32 
 
 
564 aa  481  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.24 
 
 
559 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.67 
 
 
571 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.2 
 
 
548 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  45 
 
 
562 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.09 
 
 
571 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  43.74 
 
 
577 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.65 
 
 
574 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.68 
 
 
569 aa  478  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.42 
 
 
566 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.13 
 
 
587 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.55 
 
 
563 aa  478  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  44.19 
 
 
578 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.13 
 
 
556 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.31 
 
 
582 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.32 
 
 
570 aa  475  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.62 
 
 
571 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.54 
 
 
561 aa  474  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.86 
 
 
557 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05291  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.65 
 
 
617 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.32 
 
 
570 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>