66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0026 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3887  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  347  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03558  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  347  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4182  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  347  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03501  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  347  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0026  putative transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  347  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4244  hypothetical protein  99.39 
 
 
165 aa  346  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0029  putative transcriptional regulator  99.39 
 
 
165 aa  344  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4040  hypothetical protein  97.58 
 
 
165 aa  341  3e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.57487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5106  hypothetical protein  96.97 
 
 
165 aa  338  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.324773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4133  hypothetical protein  47.73 
 
 
176 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4084  hypothetical protein  47.73 
 
 
176 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4191  hypothetical protein  47.73 
 
 
176 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4012  f165  47.73 
 
 
176 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4029  f165  47.16 
 
 
176 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.64 
 
 
398 aa  80.1  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.87 
 
 
395 aa  74.3  6e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.87 
 
 
395 aa  74.3  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.87 
 
 
396 aa  74.3  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.87 
 
 
396 aa  73.9  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 
397 aa  62.4  3e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 
405 aa  61.6  4e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 
381 aa  55.1  4e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 
367 aa  55.1  5e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.81 
 
 
398 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.81 
 
 
398 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  35.53 
 
 
440 aa  52  3e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.81 
 
 
398 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.81 
 
 
398 aa  52  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  31.25 
 
 
414 aa  50.4  1e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  31.19 
 
 
407 aa  50.4  1e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 
393 aa  49.3  3e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.86 
 
 
398 aa  48.5  4e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
407 aa  47.8  7e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  26.73 
 
 
411 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  26.73 
 
 
411 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.26 
 
 
431 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.26 
 
 
431 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.37 
 
 
447 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 
444 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.26 
 
 
431 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  30.43 
 
 
438 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  25.74 
 
 
411 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.04917e-06  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  36.17 
 
 
414 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 
435 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 
411 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.2782e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 
411 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  25.74 
 
 
411 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.97695e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
435 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 
435 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
410 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  24.75 
 
 
411 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.74144e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  24.75 
 
 
411 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.31519e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
410 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  24.75 
 
 
411 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.33586e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.25 
 
 
431 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.78 
 
 
383 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
431 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  40.91 
 
 
433 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  26.51 
 
 
408 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 
408 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  25.53 
 
 
385 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 
385 aa  40.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 
385 aa  40.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 
385 aa  40.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 
385 aa  40.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  25.53 
 
 
385 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>