19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0025 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03559  predicted inner membrane protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03502  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.760134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5107  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4243  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4041  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.796724 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0025  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4183  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3888  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0028  conserved hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  5e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4192  inner membrane protein YidG  82.76 
 
 
120 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4030  inner membrane protein YidG  82.76 
 
 
120 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4013  inner membrane protein YidG  82.76 
 
 
120 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4134  hypothetical protein  81.9 
 
 
120 aa  196  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4085  inner membrane protein YidG  81.9 
 
 
120 aa  196  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0020  hypothetical protein  71.79 
 
 
118 aa  153  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26240  protein of unknown function DUF  60.61 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1718  hypothetical protein  38.24 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3236  hypothetical protein  89.47 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2928  hypothetical protein  58.06 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>