More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0020 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03566  arbutin specific enzyme IIBC component of PTS  99.63 
 
 
538 aa  1085  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0017  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  80.3 
 
 
538 aa  900  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3323  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  63.26 
 
 
524 aa  660  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5114  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  100 
 
 
538 aa  1091  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.424783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4047  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  99.63 
 
 
538 aa  1088  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3894  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  99.81 
 
 
625 aa  1086  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0020  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  100 
 
 
538 aa  1091  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4237  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  95.17 
 
 
582 aa  1002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03510  hypothetical protein  99.46 
 
 
368 aa  732  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4190  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  100 
 
 
625 aa  1089  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2347  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  50.28 
 
 
534 aa  517  1e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.276273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2390  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  50.28 
 
 
534 aa  517  1e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000410  phosphotransferase system alpha-glucoside-specific IIBC component  49.22 
 
 
505 aa  492  1e-138  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1909  PTS system, IIBC components  48.87 
 
 
529 aa  480  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0453  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  42.4 
 
 
529 aa  421  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  8.81865e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03509  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  336  7e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3019  PTS system, glucose-like IIB subunint  35.69 
 
 
526 aa  303  7e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3015  PTS system, glucose-like IIB subunint  35.3 
 
 
514 aa  300  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2008  PTS system, glucose-like IIB subunint  35.42 
 
 
519 aa  284  3e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0259119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2105  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  32.5 
 
 
724 aa  275  1e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.684712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1768  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  32.97 
 
 
751 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0227  PTS system, glucose-like IIB subunint  34.45 
 
 
509 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0233  PTS system, glucose-like IIB subunint  34.45 
 
 
509 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1531  PTS system, glucose-like IIB subunint  35.36 
 
 
513 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.930171  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0921  PTS system, glucose-like IIB subunint  33.94 
 
 
551 aa  260  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  1.71728e-07  unclonable  9.61967e-19 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0267  PTS system, glucose-like IIB subunint  33.15 
 
 
538 aa  258  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2114  PTS system, IIABC components  33.21 
 
 
675 aa  256  8e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  2.4561e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0179  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  33.33 
 
 
681 aa  254  4e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0174  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  33.33 
 
 
681 aa  254  4e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2561  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  32.68 
 
 
688 aa  253  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2614  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  32.68 
 
 
688 aa  253  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2435  PTS system, glucose-like IIB subunint  33.09 
 
 
537 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.23051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1459  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  32.3 
 
 
658 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1079  PTS system, glucose-specific IIABC component  31.93 
 
 
687 aa  239  7e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  4.15149e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4181  PTS system, glucose-specific IIABC component  31.79 
 
 
687 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000423391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3879  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  31.93 
 
 
687 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.022221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0912  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  32.47 
 
 
675 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0301112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4105  PTS system, glucose-like IIB subunint  32.74 
 
 
551 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.760265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4159  PTS system, glucose-specific IIABC component  32.11 
 
 
687 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2749  PTS system, glucose-specific IIABC component  32.14 
 
 
687 aa  238  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000288735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4070  PTS system, glucose-specific IIABC component  31.93 
 
 
687 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3791  PTS system, glucose-specific IIABC component  31.93 
 
 
687 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00308281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3806  PTS system, glucose-specific IIABC component  31.93 
 
 
687 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.012725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4269  PTS system glucose-specific transporter subunit IIABC  32.11 
 
 
687 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0476217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3960  PTS system glucose-specific transporter subunit IIABC  32.11 
 
 
687 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3231  PTS system, glucose-like IIB subunint  33.39 
 
 
518 aa  237  5e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0314624  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4117  PTS system, glucose-specific IIABC component  31.93 
 
 
687 aa  237  5e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2333  bifunctional PTS system maltose and glucose-specific transporter subunits IICB  32.9 
 
 
530 aa  234  4e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2412  PTS system, glucose-specific IIBC component  34.83 
 
 
509 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1785  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  31.78 
 
 
672 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1829  bifunctional PTS system maltose and glucose-specific transporter subunits IICB  32.9 
 
 
530 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1696  bifunctional PTS system maltose and glucose-specific transporter subunits IICB  32.9 
 
 
530 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1578  bifunctional PTS system maltose and glucose-specific transporter subunits IICB  32.9 
 
 
530 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1563  bifunctional PTS system maltose and glucose-specific transporter subunits IICB  33.09 
 
 
530 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.802784  normal  0.303466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2021  PTS system, maltose and glucose-specific IIBC subunit  32.72 
 
 
530 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.271957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01580  hypothetical protein  32.72 
 
 
530 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.232012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01590  fused maltose and glucose-specific PTS enzymes: IIB component - IIC component  32.72 
 
 
530 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.244243  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1809  bifunctional PTS system maltose and glucose-specific transporter subunits IICB  32.72 
 
 
530 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2124  PTS system, glucose-specific IIBC component  34.64 
 
 
509 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3660  PTS system, glucose-like IIB subunint  31.82 
 
 
527 aa  229  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1914  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.94 
 
 
477 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000704692  decreased coverage  8.20581e-07 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2026  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.75 
 
 
477 aa  227  5e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.29082e-09  hitchhiker  1.05555e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01105  hypothetical protein  30.75 
 
 
477 aa  227  5e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0824942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2546  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  30.75 
 
 
477 aa  227  5e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  9.66269e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1586  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.38 
 
 
477 aa  227  5e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.2846e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01097  fused glucose-specific PTS enzymes: IIB component/IIC component  30.75 
 
 
477 aa  227  5e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1480  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.75 
 
 
477 aa  227  5e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.07598e-06  hitchhiker  8.61418e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1223  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.75 
 
 
477 aa  227  5e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.78897e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2500  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.75 
 
 
477 aa  227  5e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  unclonable  1.87594e-08 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1222  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.75 
 
 
477 aa  227  5e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.45559e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1694  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.38 
 
 
477 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3490  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.38 
 
 
477 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000103977  normal  0.0445474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2223  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.75 
 
 
477 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00198065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1302  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.62 
 
 
477 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000187593  hitchhiker  1.01411e-09 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1317  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.43 
 
 
477 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.260582  hitchhiker  8.80902e-09 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2166  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.43 
 
 
477 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.45643e-09 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1982  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.43 
 
 
477 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.21728e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1279  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.43 
 
 
477 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0278646  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2263  PTS system, maltose and glucose-specific IIBC subunit  35.5 
 
 
474 aa  221  2e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0839727  hitchhiker  0.000457732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3067  PTS system, glucose-like IIB subunint  32.36 
 
 
531 aa  221  4e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1616  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.83 
 
 
477 aa  220  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.38827e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2932  PTS system glucose-specific iibc component  31.38 
 
 
513 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4421e-10 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0665  pts system, iibc component  30.8 
 
 
514 aa  218  2e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.764807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1827  bifunctional PTS system maltose and glucose-specific transporter subunits IICB  31.81 
 
 
530 aa  218  3e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0221427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1595  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  32.34 
 
 
477 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2495  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.06 
 
 
477 aa  216  6e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00256053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1631  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  32.34 
 
 
477 aa  216  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  4.58512e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1615  bifunctional PTS system maltose and glucose-specific transporter subunits IICB  30.26 
 
 
525 aa  216  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2799  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  29.92 
 
 
477 aa  215  2e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0931776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2725  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  31.43 
 
 
468 aa  213  6e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1204  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  32.14 
 
 
498 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0450  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  31.16 
 
 
589 aa  209  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1599  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  30.38 
 
 
500 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0308  PTS system, glucose-like IIB subunint  31.75 
 
 
658 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0724  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  30.8 
 
 
588 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3172  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  30.8 
 
 
588 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0568  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  29.52 
 
 
579 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.93473e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0296  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  30.5 
 
 
588 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881602  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1446  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  30.8 
 
 
588 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0538  pts system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  30.8 
 
 
586 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>