130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0018 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3896  hypothetical protein  99.82 
 
 
553 aa  1092  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0018  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1093  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0013  hypothetical protein  74.82 
 
 
552 aa  834  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0036  hypothetical protein  75.54 
 
 
552 aa  814  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4034  hypothetical protein  88.07 
 
 
553 aa  964  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1470  hypothetical protein  63.7 
 
 
552 aa  697  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0186692  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4089  hypothetical protein  88.25 
 
 
553 aa  965  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3793  hypothetical protein  75 
 
 
552 aa  835  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212534  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03512  hypothetical protein  99.82 
 
 
553 aa  1092  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0015  hypothetical protein  84.27 
 
 
553 aa  897  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4196  hypothetical protein  88.25 
 
 
553 aa  966  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0050  hypothetical protein  75 
 
 
552 aa  826  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.259185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4191  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1093  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4138  hypothetical protein  88.43 
 
 
553 aa  967  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4141  hypothetical protein  74.82 
 
 
552 aa  834  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4236  hypothetical protein  99.82 
 
 
553 aa  1092  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0019  YidE/YbjL duplication  100 
 
 
553 aa  1093  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4017  hypothetical protein  88.25 
 
 
553 aa  965  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.837569  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03568  hypothetical protein  99.82 
 
 
553 aa  1092  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0042  hypothetical protein  75.54 
 
 
552 aa  812  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5115  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1093  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.44003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4048  hypothetical protein  99.82 
 
 
553 aa  1092  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.926821  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1568  YidE/YbjL duplication  40.87 
 
 
559 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1411  hypothetical protein  42.6 
 
 
561 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.540338 
 
 
-
 
NC_002950  PG0562  hypothetical protein  34.96 
 
 
558 aa  307  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0018  YidE/YbjL duplication  32.84 
 
 
529 aa  290  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0175151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2711  YidE/YbjL duplication  34.33 
 
 
549 aa  279  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129476  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1965  YidE/YbjL duplication  34.07 
 
 
549 aa  275  1e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103303  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0607  YidE/YbjL duplication  33.96 
 
 
541 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617712  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0870  YidE/YbjL duplication  31.76 
 
 
534 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1848  YidE/YbjL duplication  32.71 
 
 
545 aa  253  8e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3636  YidE/YbjL duplication  31.07 
 
 
546 aa  253  8e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  3.80153e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1016  Trk family potassium uptake protein  30.7 
 
 
546 aa  244  2e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2550  TrkA-C:YidE/YbjL duplication  29.85 
 
 
546 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.72993e-06  hitchhiker  6.9423e-13 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2351  YidE/YbjL duplication  31.42 
 
 
531 aa  226  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  7.18232e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0856  YidE/YbjL duplication  30.47 
 
 
537 aa  219  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.682157  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2318  YidE/YbjL like transporter  29.03 
 
 
544 aa  215  2e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1552  YidE/YbjL duplication  29.78 
 
 
544 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1553  YidE/YbjL duplication  30.39 
 
 
529 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1476  YidE/YbjL duplication  28.65 
 
 
530 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1280  YidE/YbjL duplication  28.85 
 
 
531 aa  177  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0891  YidE/YbjL duplication  27.15 
 
 
533 aa  175  2e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0037  YidE/YbjL duplication  28.67 
 
 
531 aa  174  3e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4141  YidE/YbjL duplication  28.7 
 
 
530 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2470  YidE/YbjL duplication  28.88 
 
 
522 aa  166  7e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  4.763e-05  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3956  YidE/YbjL duplication  28.15 
 
 
530 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0715  hypothetical protein  26.93 
 
 
558 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2029  hypothetical protein  27.07 
 
 
560 aa  158  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0129834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17890  YidE/YbjL duplication  27.88 
 
 
521 aa  154  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.286246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1952  hypothetical protein  25.4 
 
 
562 aa  153  9e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00456321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02636  hypothetical protein  26.65 
 
 
560 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1686  hypothetical protein  24.82 
 
 
562 aa  150  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0560693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003763  TrkA Potassium channel-family protein  27.52 
 
 
511 aa  146  8e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.4665e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2393  hypothetical protein  24.91 
 
 
562 aa  146  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1639  hypothetical protein  25.54 
 
 
562 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01390  predicted permease  29.38 
 
 
522 aa  143  1e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2734  hypothetical protein  24.69 
 
 
562 aa  142  1e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1559  hypothetical protein  24.69 
 
 
562 aa  142  1e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2649  hypothetical protein  24.69 
 
 
562 aa  142  1e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0919  hypothetical protein  24.96 
 
 
561 aa  143  1e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3938  YidE/YbjL duplication  27.1 
 
 
559 aa  142  1e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2485  hypothetical protein  24.96 
 
 
561 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2795  YidE/YbjL duplication  24.96 
 
 
561 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1023  hypothetical protein  24.16 
 
 
561 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1004  hypothetical protein  24.16 
 
 
561 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492051  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0943  hypothetical protein  24.16 
 
 
561 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0874  hypothetical protein  24.96 
 
 
561 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0907  hypothetical protein  24.16 
 
 
561 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1001  hypothetical protein  24.96 
 
 
561 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588292  normal  0.272604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0950  hypothetical protein  24.96 
 
 
561 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00858  hypothetical protein  24.96 
 
 
561 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0975  hypothetical protein  24.16 
 
 
561 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00852  hypothetical protein  24.96 
 
 
561 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2749  hypothetical protein  24.96 
 
 
561 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1362  hypothetical protein  23.8 
 
 
561 aa  140  5e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2293  hypothetical protein  24.87 
 
 
562 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1851  YidE/YbjL duplication  25.85 
 
 
561 aa  129  1e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0417927  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3841  YidE/YbjL duplication  25 
 
 
565 aa  128  2e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0482  YidE/YbjL duplication  26.08 
 
 
527 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1586  YidE/YbjL duplication  23.72 
 
 
563 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3892  aspartate/alanine exchanger family protein  26.97 
 
 
560 aa  123  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2143  hypothetical protein  23.1 
 
 
562 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3045  YidE/YbjL duplication  24.86 
 
 
560 aa  113  8e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2708  YidE/YbjL duplication  25.61 
 
 
561 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0096  YidE/YbjL duplication  26.33 
 
 
561 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0519277  normal  0.835648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1985  YidE/YbjL duplication  23.02 
 
 
561 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0595755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3913  YidE/YbjL domain-containing protein  26.1 
 
 
589 aa  106  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0230126  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3839  YidE/YbjL duplication  24.54 
 
 
562 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4847  putative transporter  26.15 
 
 
567 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0674099  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3482  YidE/YbjL duplication  25.54 
 
 
563 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2707  YidE/YbjL duplication  25.55 
 
 
564 aa  97.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0789  YidE/YbjL duplication  26.27 
 
 
560 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0281  YidE/YbjL duplication  24.22 
 
 
549 aa  90.1  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00426862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0788  YidE/YbjL duplication  25.33 
 
 
560 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.442707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2952  YidE/YbjL duplication  23.94 
 
 
579 aa  85.1  3e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4738  YidE/YbjL duplication  22.73 
 
 
581 aa  84  6e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03065  hypothetical protein  22.64 
 
 
575 aa  79.7  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1198  probable membrane permease  22.84 
 
 
625 aa  78.6  3e-13  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3893  aspartate/alanine exchanger family protein  24.53 
 
 
560 aa  72.4  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1872  YidE/YbjL duplication  31.61 
 
 
376 aa  65.1  3e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.590768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>