37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0015 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0015  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  281  2e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4197  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  281  2e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4231  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  281  2e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3900  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  281  2e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03571  conserved outer membrane protein  100 
 
 
110 aa  228  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0015  protein of unknown function DUF1375  100 
 
 
110 aa  228  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03515  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  228  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5121  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4020  hypothetical protein  89.36 
 
 
96 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4199  hypothetical protein  89.36 
 
 
96 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0012  hypothetical protein  78.7 
 
 
110 aa  178  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.554308  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4053  hypothetical protein  97.67 
 
 
86 aa  178  3e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4037  hypothetical protein  88.3 
 
 
96 aa  176  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4141  hypothetical protein  89.29 
 
 
86 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4092  hypothetical protein  89.29 
 
 
86 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0038  hypothetical protein  44.83 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3915  protein of unknown function DUF1375  43.48 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3796  hypothetical protein  43.27 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0033  hypothetical protein  42.24 
 
 
130 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4144  hypothetical protein  43.27 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0010  hypothetical protein  43.27 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4106  protein of unknown function DUF1375  39.82 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0047  hypothetical protein  53.85 
 
 
114 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.320831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1368  lipoprotein, putative  45.9 
 
 
95 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00111167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1181  hypothetical protein  38.46 
 
 
95 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.731891  normal  0.209596 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2595  protein of unknown function DUF1375  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1430  hypothetical protein  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.193761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01055  hypothetical protein  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0192844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01047  predicted lipoprotein  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0125641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1173  hypothetical protein  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0826653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1172  hypothetical protein  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.15827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2279  hypothetical protein  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2079  hypothetical protein  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2549  hypothetical protein  35 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0255653  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1566  hypothetical protein  39.06 
 
 
75 aa  42  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489739  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1872  hypothetical protein  32.39 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1056  hypothetical protein  32.22 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>