37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0014 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03572  hypothetical protein  98.76 
 
 
404 aa  825  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4054  hypothetical protein  98.02 
 
 
404 aa  821  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0014  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  836  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4039  putative cytoplasmic protein  78.68 
 
 
408 aa  668  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4201  putative ATP/GTP-binding protein  79.17 
 
 
408 aa  674  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4198  hypothetical protein  98.76 
 
 
404 aa  825  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3901  hypothetical protein  98.02 
 
 
404 aa  822  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4230  hypothetical protein  97.35 
 
 
356 aa  690  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0014  conserved hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  836  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0011  putative ATP/GTP-binding protein  74.51 
 
 
408 aa  635  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551197  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5122  hypothetical protein  96.53 
 
 
416 aa  810  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.116872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03516  hypothetical protein  98.76 
 
 
404 aa  825  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0046  hypothetical protein  64.46 
 
 
426 aa  539  1e-152  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0032  hypothetical protein  62.41 
 
 
434 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0009  hypothetical protein  62.95 
 
 
433 aa  517  1e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0037  hypothetical protein  60.93 
 
 
428 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4109  hypothetical protein  60.54 
 
 
427 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3923  hypothetical protein  59.56 
 
 
427 aa  485  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4309  hypothetical protein  37.14 
 
 
460 aa  244  2e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0549386  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  34.58 
 
 
419 aa  53.5  6e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.32 
 
 
682 aa  52.4  2e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  35.85 
 
 
441 aa  51.6  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
642 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.45 
 
 
673 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  29.73 
 
 
1138 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  24.78 
 
 
1008 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.69 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.84 
 
 
610 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  30.52 
 
 
1010 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.64 
 
 
660 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.16 
 
 
708 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.69 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  28.04 
 
 
427 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  29.46 
 
 
1062 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.1 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  30.1 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.21 
 
 
667 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>