86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0009 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  100 
 
 
292 aa  604  1e-172  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  100 
 
 
292 aa  604  1e-172  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3906  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  99.66 
 
 
292 aa  601  1e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03577  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  98.97 
 
 
292 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03521  hypothetical protein  98.97 
 
 
292 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.225897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4203  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  98.29 
 
 
292 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4059  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  96.58 
 
 
292 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1097  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  96.23 
 
 
292 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0007  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  83.22 
 
 
292 aa  488  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4163  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  82.19 
 
 
292 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4114  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  82.19 
 
 
292 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4221  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  81.85 
 
 
292 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0023  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  54.39 
 
 
298 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0042  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  53.38 
 
 
297 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.351596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2605  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  38.85 
 
 
302 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1287  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  37.37 
 
 
316 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0108847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2012  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.77 
 
 
319 aa  164  2e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975056  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0743  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.83 
 
 
299 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6031  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.92 
 
 
303 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0444196  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0949  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  36.53 
 
 
351 aa  155  5e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2068  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.67 
 
 
309 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.195031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03723  putative conserved protein  34.39 
 
 
334 aa  153  3e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4213  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.6 
 
 
334 aa  153  3e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03672  hypothetical protein  34.39 
 
 
334 aa  153  3e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0054  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.26 
 
 
292 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3700  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  36.61 
 
 
341 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1242  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.17 
 
 
298 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.502361  normal  0.183094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3690  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.24 
 
 
302 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0545  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.7 
 
 
305 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2872  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.34 
 
 
324 aa  148  1e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0028  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  36.8 
 
 
307 aa  147  2e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3534  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.67 
 
 
295 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  35.71 
 
 
346 aa  145  8e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0586  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.71 
 
 
341 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0942826  normal  0.0399726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2767  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.95 
 
 
341 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0502  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.24 
 
 
304 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.71 
 
 
341 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313039  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0135  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.71 
 
 
341 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0543  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  34.46 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0519  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.02 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3414  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.47 
 
 
350 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302272  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0543  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.68 
 
 
341 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436571  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0962  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.71 
 
 
296 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4620  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.22 
 
 
295 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0937  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.71 
 
 
296 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0437  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.67 
 
 
306 aa  140  2e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3833  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  34.67 
 
 
303 aa  140  2e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51340  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.33 
 
 
322 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00123  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  35.14 
 
 
292 aa  139  4e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3914  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  35.44 
 
 
284 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0112503  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6942  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  37.12 
 
 
380 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  9.67621e-09  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0845  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.96 
 
 
305 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1176  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.78 
 
 
337 aa  136  3e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1269  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0409  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3296  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3488  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0898  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.38 
 
 
353 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4125  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.33 
 
 
329 aa  135  1e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505866  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2246  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  36.47 
 
 
350 aa  134  2e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279182  hitchhiker  4.35705e-06 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.67 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3451  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.67 
 
 
337 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2177  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  33.89 
 
 
334 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.075101  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3594  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.69 
 
 
324 aa  132  7e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.943632  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0038  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.63 
 
 
307 aa  132  8e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0392  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.9 
 
 
328 aa  131  2e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0939  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  31.23 
 
 
309 aa  129  7e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.340074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0881  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  31.23 
 
 
309 aa  129  7e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4804  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.75 
 
 
293 aa  129  8e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0138053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1987  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.22 
 
 
334 aa  128  9e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.021694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1422  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  32.28 
 
 
309 aa  128  1e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4929  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.72 
 
 
304 aa  127  2e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876987  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2598  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  32.09 
 
 
296 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1371  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.85 
 
 
307 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3954  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.88 
 
 
334 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3665  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.94 
 
 
315 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000857364  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3614  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.81 
 
 
307 aa  121  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2748  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  35.94 
 
 
300 aa  121  1e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3530  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.25 
 
 
318 aa  121  1e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3489  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.32 
 
 
304 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1015  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  35.24 
 
 
335 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174536  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2759  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  25.37 
 
 
331 aa  71.6  1e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2588  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  24.25 
 
 
337 aa  68.2  2e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2998  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  24.25 
 
 
337 aa  67.4  3e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296432  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3778  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  27.5 
 
 
345 aa  57.4  3e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.585219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>