14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0007 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0007  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3908  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03579  predicted lipoproteinC  99.54 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4205  hypothetical protein  99.54 
 
 		 253 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.518321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5124  hypothetical protein  99.08 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.22364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03523  hypothetical protein  99.54 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4061  hypothetical protein  60.56 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3798  hypothetical protein  45.81 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3865  hypothetical protein  45.81 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1641  hypothetical protein  29.52 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3515  hypothetical protein  29.52 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1752  hypothetical protein  29.52 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0026  hypothetical protein  24.55 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0670841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>