36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0008 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  97.47 
 
 
79 bp  141  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  90 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  90 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.510078  normal  0.0905672 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  91.43 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0034  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.870471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  91.43 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4331  tRNA-Pro  87.27 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0021  tRNA-Pro  87.27 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0028  tRNA-Pro  87.27 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  91.43 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 
98 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 
67 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0022  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119754  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0018  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338609  normal  0.373467 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 
104 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>