More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0540 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0540  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  100 
 
 		 323 aa  652    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.373783  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0486  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  85.14 
 
 		 337 aa  556  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.766955  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1162  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.43 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0658766  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.29 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2719  RluA family pseudouridine synthase  37.42 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.344852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  38.02 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  36.42 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7584  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0816319  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  34.49 
 
 		 377 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.5 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.5 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2164  RluA family pseudouridine synthase  34.99 
 
 		 482 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.317837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  37.27 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0473  pseudouridine synthase, RluA family  35.91 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.23 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.23 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6848  RluA family pseudouridine synthase  36.65 
 
 		 336 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  37.08 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3480  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.26 
 
 		 348 aa  228  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0583016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  36.75 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  37.27 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0968  pseudouridine synthase, RluA family  34.92 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0372  pseudouridine synthase, RluA family  37.07 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1005  RluA family pseudouridine synthase  34.92 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0345  RluA family pseudouridine synthase  38.17 
 
 		 351 aa  225  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  40 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  38.82 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  38.02 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1390  pseudouridine synthase, RluA family  36.77 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0454  pseudouridine synthase RluD  36.22 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2406  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.29 
 
 		 335 aa  222  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0234677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0553  pseudouridine synthase, RluA family  37.26 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0359  pseudouridine synthase RluD  36.11 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000104546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.59 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  40.58 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.69 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2308  pseudouridine synthase, RluA family  33.64 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3401  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.86 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0606  pseudouridine synthase RluD  35.21 
 
 		 391 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.32929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  35.22 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5641  RluA family pseudouridine synthase  37.11 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0784245  normal  0.0662389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.46 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997976  normal  0.952064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.36 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0665  hypothetical protein  37.3 
 
 		 341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2118  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.2 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1440  pseudouridine synthase, RluA family  35.05 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.738263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.22 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0348  RluA family pseudouridine synthase  36.08 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  36.36 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3046  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.84 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1573  RluA family pseudouridine synthase  35.78 
 
 		 349 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105453  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2620  RluA family pseudouridine synthase  37.58 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1495  pseudouridine synthase, RluA family  37.11 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.65 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  34.08 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  38.44 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  40.68 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.99 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.03 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  37.11 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2215  RluA family pseudouridine synthase  32.94 
 
 		 341 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  37.54 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2409  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.12 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  39.53 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  37.46 
 
 		 329 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2431  pseudouridine synthase, RluD  34.85 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0293774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  39.37 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  41.56 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0783  pseudouridine synthase, RluD  33.94 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1072  RluA family pseudouridine synthase  34.12 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0863187  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  41.56 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  38.39 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1219  pseudouridine synthase, RluA family  36.69 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  36.89 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  35.06 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1621  pseudouridine synthase, RluA family  33.73 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2467  pseudouridine synthase, RluA family  36.57 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.235173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  37.74 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2550  pseudouridine synthase, RluD  37.69 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.347335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.77 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2578  pseudouridine synthase, RluA family  35.48 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1911  pseudouridine synthase, RluA family  36.31 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  39.75 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.87 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1622  pseudouridine synthase, RluD  35.02 
 
 		 363 aa  202  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  37.66 
 
 		 306 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1044  pseudouridine synthase, RluA family  33.13 
 
 		 346 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1520  pseudouridine synthase, RluA family  39.81 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  35.02 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.56 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.784854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  34.15 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  37.94 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1798  pseudouridine synthase, RluA family  34.62 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  37.62 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  36.79 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3012  RluA family pseudouridine synthase  33.88 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17598  normal  0.601739 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  38.78 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2859  pseudouridine synthase, RluD  40.74 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.1 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>