58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0166 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0016  surface exclusion protien  37.33 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  33.52 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  32.96 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  32.96 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  37.38 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  37.38 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  38.1 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  32.96 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  34.55 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  32.4 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  32.09 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.83 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  26.83 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  26.83 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  26.83 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  35 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  29.27 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  28.46 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  32.79 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  35.05 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  27.01 
 
 		 286 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  40.24 
 
 		 420 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  31.91 
 
 		 319 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  26.98 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  32.18 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  30.53 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  31.58 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  24.14 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  31.58 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  44.44 
 
 		 528 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  32.26 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  24.76 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  27.34 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  26.73 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0062  abortive infection protein  31.4 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  32.14 
 
 		 420 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  26.97 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  26.97 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  26.97 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  26.97 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  26.97 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  26.97 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  25.84 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  26.97 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  26.58 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  26.97 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  25.84 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  35.11 
 
 		 448 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  40.74 
 
 		 515 aa  42  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  31.88 
 
 		 225 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  35.11 
 
 		 448 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  32.5 
 
 		 260 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  33.96 
 
 		 345 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5328  Abortive infection protein  36.23 
 
 		 295 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  34.09 
 
 		 453 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>