76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4908 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  99.35 
 
 		 157 aa  306  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  98.06 
 
 		 157 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  98.06 
 
 		 157 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  98.06 
 
 		 157 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  98.71 
 
 		 157 aa  303  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  97.42 
 
 		 157 aa  301  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  89.68 
 
 		 157 aa  281  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  87.74 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  87.74 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  87.74 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  87.74 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  87.74 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  75.32 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  75.97 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  75.97 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  73.55 
 
 		 156 aa  235  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  70.97 
 
 		 156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  75.5 
 
 		 157 aa  227  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  69.48 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  71.43 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  59.48 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  58.06 
 
 		 157 aa  190  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  56.29 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  52.63 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  49.03 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  48.7 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  48.7 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  48.7 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  48.7 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  48.05 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  47.4 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  46.75 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  46.75 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  47.68 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  46.75 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  47.4 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  46.75 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  46.1 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  47.06 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  44.81 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  46.98 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  44.14 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  46.21 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  42.95 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  34.25 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  33.57 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  32.19 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  30.34 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  30.82 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  30.61 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  27.74 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  33.85 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  29.13 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  29.6 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  28.81 
 
 		 426 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  30.51 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  28.41 
 
 		 478 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  31.11 
 
 		 440 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  28.42 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  26.24 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  31.18 
 
 		 637 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  27.66 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2819  hypothetical protein  30.53 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  26.67 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  27.41 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  25.25 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>