More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4760 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  52.77 
 
 		 675 aa  694    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  53.74 
 
 		 675 aa  705    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  100 
 
 		 659 aa  1363    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  46.44 
 
 		 659 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  48.34 
 
 		 655 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  46.57 
 
 		 658 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  46.21 
 
 		 661 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  46.13 
 
 		 661 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  45.43 
 
 		 661 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  44.64 
 
 		 676 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  44.93 
 
 		 683 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  44.64 
 
 		 676 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.19 
 
 		 680 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  41.72 
 
 		 673 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  42.32 
 
 		 673 aa  527  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  44.14 
 
 		 611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  40.96 
 
 		 670 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.89 
 
 		 676 aa  502  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  41.3 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  47.11 
 
 		 806 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  51.59 
 
 		 675 aa  488  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  48.73 
 
 		 777 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  41.27 
 
 		 686 aa  482  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  38.74 
 
 		 708 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  37.87 
 
 		 709 aa  481  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.42 
 
 		 663 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  41.21 
 
 		 607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  41.93 
 
 		 661 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  50.11 
 
 		 580 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  37.28 
 
 		 728 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  36.61 
 
 		 725 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  46.07 
 
 		 583 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  43.12 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.73 
 
 		 586 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.14 
 
 		 644 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  34.89 
 
 		 677 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  34.85 
 
 		 589 aa  355  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  34.41 
 
 		 636 aa  346  6e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  33.61 
 
 		 725 aa  345  1e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  39.68 
 
 		 587 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  33.43 
 
 		 710 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  33.19 
 
 		 647 aa  333  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  37.83 
 
 		 592 aa  333  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  44.36 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  37.45 
 
 		 778 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  34.45 
 
 		 793 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  36.57 
 
 		 790 aa  300  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  34.21 
 
 		 783 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  35.26 
 
 		 794 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  33.94 
 
 		 787 aa  294  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  34.56 
 
 		 829 aa  293  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  34.32 
 
 		 608 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  36.02 
 
 		 793 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  33.47 
 
 		 799 aa  273  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  36.86 
 
 		 763 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  36.55 
 
 		 552 aa  256  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  40.93 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  30.38 
 
 		 496 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  30.91 
 
 		 498 aa  176  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  30.25 
 
 		 697 aa  176  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.21 
 
 		 587 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.51 
 
 		 633 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  28.92 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  28.86 
 
 		 498 aa  160  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.2 
 
 		 495 aa  160  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  29.35 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.59 
 
 		 574 aa  157  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  29.2 
 
 		 523 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  29.2 
 
 		 508 aa  154  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.08 
 
 		 574 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  27.13 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.98 
 
 		 505 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.65 
 
 		 504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.94 
 
 		 499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 		 499 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.1 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  26.19 
 
 		 510 aa  145  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  27 
 
 		 908 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  27.61 
 
 		 808 aa  144  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.05 
 
 		 501 aa  144  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 		 814 aa  143  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.15 
 
 		 822 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  28.01 
 
 		 847 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  26.49 
 
 		 522 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  26.54 
 
 		 815 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.99 
 
 		 497 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  26.68 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  26.64 
 
 		 518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.65 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  27.65 
 
 		 495 aa  138  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  27.21 
 
 		 814 aa  138  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  27.9 
 
 		 505 aa  137  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  28.88 
 
 		 499 aa  137  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  27.83 
 
 		 810 aa  137  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  25.78 
 
 		 810 aa  137  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  29.55 
 
 		 493 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  33.69 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  27.93 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  24.11 
 
 		 510 aa  135  3e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>